Recombined Template REC-0-1_002

Consensus Sequence

DFVLTQSPHSLSVTPGESASISCKSSHSLLHGDRSNYLAWYVQKPGRSPQLLIDLASERASGVPDRFSGSGSDKDFTLKISRVETEDVGTYYCMQGRESPWTFGQGTKVDIKRSLAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREALVNWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYTLNSTLTLLKAYYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFGRNEC

Annotated Consensus Sequence

ConsensusTemplate

FIF

LML

HLH

SPS

KRK

CDR1HQH

GSG

DND

RGR

SYS

ADA

VLV

RQR

DYD

CDR2LL

AGA

ENE

DGD

KTK

TAT

TVT

CDR3MM

GAG

RLR

EQE

STS

DED

SLTVSL

LKL

NQN

TST

NSN

LSL

YDY

GNG

NGN

Legend

CDRConservedPossible glycosylation site

Sequence Consensus Overview

GDTQT

EQSQA

DSA

GLP

STV

LAG

SGT

TSCS

HLCA

HDLK

QHETS

GTYS

KQPH

PCL

KMH

VASHD

SLMQHAGNR

RPGFWMNHLS

YGN

GAMSW

PGP

SGA

LGQR

LEP

LSA

LETS

SDVE

PKR

GPAGT

EQTVSA

MTVG

ETV

FGAP

LWGD

QEAR

ADQF

TPKDS

KAQSG

DCTSGS

SGA

EYS

RWSTED

YLEK

ENLD

PQLFTF

QRLPKTKTLA

DPLA

MVLYNKA

EAGS

LKGLR

RVLD

FEA

LPT

ATY

HMASC

DPCEM

SVR

YQRSE

AMFSW

GSA

GLK

KVR

FNTGSTV

GLA

LFTA

KEAFVS

TNV

PVL

PEF

ASP

EQE

AGMQA

VPLKL

LRAGFKA

AEQGAS

DSTA

GAFV

SLC

GDGGN

TPF

VPRE

NEQGW

VMQK

SLYV

YEQD

AQNGQ

TAA

AACQ

ANS

AVDN

LDVE

VGS

GVD

VAK

SGYD

LES

SVNDT

GLY

EST

DLSN

ELNS

ANDT

QESL

GSLKA

QADHEY

MEWCDY

SDYEGVT

LTKA

VYV

VYA

GMA

ADGC

RADS

MGSFGF

RNYLGA

LSR

MSN

YCE

0		1	0	D	1	29.24027054285715	FD	2	1
1		1	0	W	1	1.2984499999999999	L	1	7.921177857142858	F	1	21.51504896666667
2	V	1	36.15111596666667
3	V	1	0.87174	L	1	39.89657246190475	TQL	3	0.6683333333333333
4	L	1	0.24952	C	1	0.4967975	Q	1	0.7129385714285715	E	1	0.96398	S	1	0.96573	V	1	0.99953	G	1	1.99055	D	1	3.69147	T	1	25.92288247142857	QT	2	2.5352750000000004
5	V	1	0.16414	N	1	0.19095	GA	1	0.47357625	L	1	0.99906	A	1	1.57917	E	1	1.6764000000000001	Q	1	24.274519700000003	NT	2	0.409135	SQ	2	2.088
6	Q	1	0.24085	E	1	0.38088	Y	1	0.94184	P	1	0.99989	T	1	1.26119	D	1	3.1649699999999994	S	1	31.639112876190477
7		1	0	D	1	0.2168	Y	1	0.4042	T	1	0.581744	E	1	0.9431	M	1	0.99839	C	1	0.9999	G	1	2.63746	L	1	2.723581785714286	P	1	37.76210908571427
8		1	0	C	1	0.5992040000000001	A	1	0.88355	G	1	0.91616	F	1	1.05742	T	1	1.59762	P	1	1.7140457142857142	L	1	10.819483214285713	H	1	21.702432833333333	SH	2	0.99346
9		1	0	G	1	0	Q	1	0.20104	K	1	0.33843	E	1	0.92908	H	1	0.96482	M	1	0.99574	L	1	1.9642171428571427	S	1	39.60526277450981	VT	2	0.62361	TV	2	3.146
10	V	1	0.29787	T	1	0.5995820000000001	Q	1	0.90684	L	1	43.44762058263305
11	G	1	0.4851	L	1	0.58117	A	1	0.9952	D	1	1	T	1	1.75537	W	1	1.8823400000000001	S	1	42.18883230812326
12		1	0	T	1	0.05183	N	1	0.6956857142857144	A	1	1	H	1	2.23932	V	1	36.73662408963586	SL	2	0.767265	LS	2	0.89352
13		1	0	W	1	0.26129	S	1	0.79266	R	1	0.97707	V	1	0.99983	T	1	44.796284056022394
14		1	0	W	1	0.49077	G	1	0.6860171428571429	K	1	0.74252	C	1	0.85557	P	1	48.497841019607826
15		1	0	P	1	0.32626	Y	1	0.94534	M	1	1	D	1	1.36677	L	1	2.98449	A	1	3.86851	G	1	38.38223242577032
16		1	0	G	1	0.39888	Y	1	0.58382	H	1	0.63388	L	1	0.99999	P	1	1	V	1	1.204164	S	1	1.55478	D	1	1.7702200000000001	K	1	2.0210966666666668	E	1	31.10000764705882
17	Y	1	0.1138	H	1	0.24981	Q	1	0.32058333333333333	E	1	0.3330033333333333	M	1	1	T	1	1.6592799999999999	D	1	1.84324	A	1	1.9984600000000001	S	1	40.38506370308124	AS	2	1	GT	2	3.246
18	C	1	0		1	0	H	1	0.566	F	1	0.6464066666666667	N	1	0.9361	L	1	0.99418	V	1	0.99828	M	1	1	A	1	41.780322885154064
19	Y	1	0		1	0	T	1	0.02098	V	1	0.3332833333333333	E	1	0.94362	G	1	0.99356	K	1	0.99712	L	1	0.99981	A	1	1	R	1	1.0713819999999998	D	1	1.95279	S	1	47.21864557422969
20		1	0	Q	1	0.45664	S	1	0.54011	P	1	0.64611	E	1	0.77125	G	1	0.99814	D	1	1.4414	L	1	47.5837956022409	SL	2	0.502045
21		1	0	V	1	0.32949	R	1	0.34524	M	1	0.88791	G	1	1.1388099999999999	L	1	1.27233	H	1	1.43868	E	1	1.65031	N	1	1.7903	P	1	2.3088033333333335	T	1	4.07883	S	1	29.807156722689076	CS	2	3.5431099999999995
22		1	0	F	1	0.08408	P	1	0.3333333333333333	T	1	0.33658	N	1	0.51159	R	1	0.94391	A	1	0.99984	W	1	1	M	1	1.21143	Y	1	1.44266	G	1	1.5941100000000001	S	1	1.93889	H	1	6.06044	L	1	6.329223333333334	C	1	23.67580966386555
23		1	0	Q	1	0.2584	G	1	0.33236666666666664	T	1	0.38652	C	1	0.42285	Y	1	0.96472	F	1	0.9815999999999999	GL	1	0.983535	E	1	1.82964	A	1	1.99702	P	1	2.16778	N	1	2.1771700000000003	H	1	2.25455	D	1	2.9107399999999997	L	1	3.333193333333333	K	1	22.78920756302521
24	F	1	0		1	0	Y	1	0.51585	C	1	0.54668	M	1	1.0471	Q	1	1.90382	H	1	1.9981	E	1	2.6227	T	1	2.68013	S	1	15.480069999999998
25	M	1	0.10237	E	1	0.18658	W	1	0.33333	N	1	1.25865	G	1	1.63151	T	1	2.26243	Y	1	3.96082	S	1	17.50099
26	N	1	0.14323	C	1	0.2171	D	1	0.91011	S	1	0.99994	K	1	1.87364	Q	1	2.72157	P	1	3.8957	H	1	13.239096666666667
27	M	1	0.18637	G	1	0.81552	E	1	1	T	1	4.415109999999999	S	1	21.815929999999998	VT	2	0.3006766666666667
28	M	1	0.07101666666666666	E	1	0.2045	D	1	0.29173	T	1	0.51778	V	1	0.92441	S	1	2.54142	L	1	21.41442
29	P	1	1.95137	C	1	1.99705	L	1	24.453073333333336
30	A	1	0.08962	E	1	0.28346	F	1	0.32839666666666667	G	1	0.9763	N	1	0.99823	K	1	1.9741	M	1	2.55979	H	1	16.48426
31	N	1	0.17832	K	1	0.72692	P	1	0.78999	Q	1	0.98272	Y	1	0.99865	E	1	1.76827	G	1	16.714386666666666
32	P	1	0.71225	M	1	0.77122	V	1	0.94654	A	1	0.95993	S	1	1.51104	H	1	1.9947300000000001	D	1	10.19511
33	E	1	0.33044999999999997	V	1	0.43377	D	1	0.63202	S	1	0.96996	L	1	0.98068	M	1	0.99771	Q	1	1.4326400000000001	H	1	1.77834	A	1	1.88724	G	1	2.53009	N	1	2.8527	R	1	2.97762
34	T	1	0.16444	R	1	0.86646	P	1	0.90945	G	1	0.94411	F	1	0.9705	W	1	0.99789	M	1	0.99852	N	1	1.3880400000000002	H	1	1.6542400000000002	L	1	2.2893133333333333	S	1	2.6565
35	L	1	0	Q	1	0.06478	C	1	0.33171666666666666	D	1	0.61365	S	1	0.9122600000000001	K	1	0.973	M	1	1.0196399999999999	R	1	1.25215	Y	1	1.63211	G	1	2.8248699999999998	N	1	19.80198141666667
36	K	1	0.31627666666666665	M	1	0.63594	H	1	0.96913	E	1	0.99945	P	1	1.98804	Y	1	27.10600475	LY	2	0.79509
37	K	1	0.11192	E	1	0.13649	R	1	0.59259	N	1	0.99617	L	1	20.40899375
38	S	1	0	C	1	0.86187	Y	1	0.97123	F	1	0.98862	W	1	0.99783	N	1	1.87849	A	1	18.240831583333335
39	N	1	0.02655	L	1	0.49677000000000004	F	1	0.56009	D	1	0.63038	G	1	1	AM	1	2.1775225	S	1	2.5983687499999997	W	1	9.780445333333333
40	Y	1	22.374539833333333	VY	2	0.59907
41	V	1	25.85829225	NL	2	0.8006
42	GA	1	0.543145	C	1	1	Q	1	26.517087583333325
43	S	1	0.78369	T	1	0.95541	A	1	0.99999	V	1	1	K	1	25.560162499999997
44	S	1	1	P	1	24.0871475	GP	2	4.5936275
45	R	1	0	P	1	0.7472	Y	1	1	A	1	1	S	1	1.8713	G	1	14.866544583333335	AN	2	0.90194
46	E	1	0.68313	A	1	0.746	L	1	1.9446400000000001	G	1	2.72419	Q	1	8.1404	R	1	17.604692
47	A	1	0.04927	G	1	0.24878	P	1	0.89372	R	1	0.97271	V	1	1.30233	E	1	1.73826	K	1	1.73976	T	1	3.9989999999999997	S	1	25.93641319047619
48		1	0	A	1	0.05611	F	1	0.20686666666666667	Y	1	0.5372	Q	1	1.0998299999999999	S	1	1.6792099999999999	L	1	1.97566	E	1	2.09773	P	1	29.225478357142855
49	G	1	0	A	1	0	E	1	0.17161	N	1	0.77048	H	1	0.85368	W	1	0.89485	L	1	0.99804	Y	1	1	S	1	1.2852000000000001	AG	1	1.49662	D	1	1.9948000000000001	V	1	2.1704	Q	1	32.97300788492064
50	P	1	0	D	1	0.00206	H	1	0.72417	S	1	0.7328766666666667	R	1	0.89193	K	1	0.92003	E	1	0.99611	A	1	1.52233	Q	1	1.86422	N	1	1.8774	L	1	47.93937022619049
51	H	1	0	Q	1	0.79381	K	1	0.95615	G	1	0.99999	V	1	1.13973	D	1	1.92519	S	1	2.95657	L	1	57.74190145634921
52	C	1	0		1	0	T	1	0	M	1	0.19811	K	1	0.65499	V	1	0.98944	E	1	0.99125	P	1	0.99994	Y	1	1.354619	A	1	1.99308	Q	1	2.5942000000000003	S	1	2.8153	L	1	51.49343084920636	VE	2	0.99829
53		1	0	N	1	0.61692	V	1	0.70326	K	1	0.88195	T	1	0.95575	W	1	0.96752	L	1	0.99997	Q	1	1.6398466666666667	E	1	1.88362	P	1	1.99524	G	1	2.1672900000000004	Y	1	7.9395515238095244	D	1	41.25089494444444
54	N	1	0	R	1	0.09074	E	1	0.97835	K	1	0.99343	T	1	0.99683	S	1	0.99789	D	1	1.88456	Q	1	1.92367	V	1	1.99884	M	1	2.72208	F	1	2.82532	G	1	3.4565	L	1	46.609912607142846
55		1	0	W	1	0.42261	V	1	0.8909866666666666	G	1	0.99947	P	1	0.99999	N	1	1	Q	1	1.2162	D	1	1.5907766666666667	E	1	1.7364199999999999	R	1	1.93156	L	1	2.99818	S	1	3.3276866666666667	A	1	32.82641373809524	TG	2	0.9996050000000001	SA	2	2.213335	GT	2	2.233815
56		1	0	Y	1	0	D	1	0.69273	G	1	0.80983	K	1	0.90716	N	1	0.95036	P	1	0.97676	M	1	0.97941	A	1	0.99737	C	1	0.99958	R	1	0.99982	V	1	2.29969	L	1	2.9876733333333334	E	1	5.21867	T	1	5.68173	S	1	22.037835035714288
57	F	1	0		1	0	Q	1	0.38094	N	1	0.91101	M	1	0.94686	P	1	0.99901	C	1	1	K	1	1.08206	R	1	1.43924	T	1	1.70954	A	1	2.008773333333333	G	1	2.18099	L	1	2.458658333333333	S	1	3.022267619047619	D	1	4.112076666666667	V	1	4.93678	E	1	22.980446694444442
58		1	0	N	1	0	GL	1	0	D	1	0.04379	Q	1	0.14744	VA	1	0.68049	E	1	0.99436	A	1	0.99945	F	1	0.99975	G	1	1.56732	S	1	1.7439	AV	1	1.94567	V	1	1.97533	P	1	3.6662916666666665	K	1	5.81579	R	1	28.041865468253967
59		1	0	Y	1	0.22158	D	1	0.44986	N	1	0.81546	R	1	0.98593	V	1	0.99985	F	1	1	L	1	1.1296816666666667	G	1	1.8454899999999999	P	1	1.99268	A	1	13.569331500000002	SA	2	0.64733	TG	2	0.856135	GT	2	1.96543125
60	K	1	0.38644	G	1	0.6665883333333334	N	1	0.81414	L	1	0.9942	A	1	0.99968	P	1	1	E	1	1.58266	Q	1	1.79493	T	1	2.99864	V	1	4.72624	S	1	6.738009000000001
61		1	0	R	1	0.07775	E	1	0.2276	L	1	0.82423	P	1	0.89757	K	1	0.982	Q	1	1.0647533333333332	M	1	1.63093	T	1	2.0298000000000003	V	1	2.67558	G	1	14.67886825
62		1	0	W	1	0.09207	M	1	0.22725	H	1	0.35711	A	1	0.50206	L	1	0.6979	R	1	0.79598	E	1	2.37821	T	1	2.8124166666666666	V	1	14.955101
63	V	1	0		1	0	K	1	0.21761	E	1	0.34667	N	1	0.88018	M	1	0.94825	F	1	1.7101199999999999	G	1	1.98487	A	1	2.9993000000000003	P	1	16.790013249999998
64	P	1	0		1	0	N	1	0.68599	T	1	0.73195	E	1	0.76018	K	1	0.91122	V	1	1	L	1	1.99548	W	1	1.99728	G	1	2.9503	D	1	16.427343083333334	RD	2	0.59967
65		1	0	F	1	0.33331666666666665	N	1	0.84005	P	1	0.99999	Q	1	1.98855	E	1	1.99147	A	1	2.69321	R	1	12.334332416666667
66		1	0	G	1	0.50427	K	1	0.77986	A	1	0.9965	D	1	1.3270333333333333	Q	1	1.99662	F	1	12.380755000000002
67		1	0	F	1	0.15907	Q	1	0.22984666666666667	A	1	0.47218000000000004	T	1	0.95028	P	1	1	K	1	1.98813	D	1	4.83388	S	1	7.550739166666667
68		1	0	P	1	0.32434	K	1	0.95738	A	1	1	Q	1	1.9832999999999998	S	1	1.98487	G	1	11.756982166666667
69		1	0	N	1	0.15958	V	1	0.43060666666666664	P	1	0.88808	D	1	0.98882	C	1	0.99552	T	1	1	S	1	12.608704333333334	GS	2	0.996455
70		1	0	N	1	0	T	1	0	R	1	0.06264	Q	1	0.30481	V	1	0.3333333333333333	D	1	0.8825	S	1	6.324603333333333	G	1	9.902366333333335
71	T	1	0	D	1	0.2029	H	1	0.32304333333333335	C	1	0.57162	E	1	0.98258	Y	1	1	S	1	13.750995833333336	DS	2	0.32859166666666667
72	N	1	0		1	0	P	1	0	V	1	0.15362666666666666	L	1	0.3333333333333333	R	1	0.99916	W	1	0.99953	S	1	0.99957	T	1	1.9758200000000001	E	1	3.610003333333334	D	1	6.803857083333334
73		1	0	AV	1	0	V	1	0.33161666666666667	N	1	0.6990225	Y	1	0.9305	L	1	1.3333266666666668	E	1	1.8893933333333333	K	1	13.061202000000002
74	Q	1	0.38171	E	1	1.03835	N	1	1.3286666666666667	L	1	3.3018199999999998	D	1	8.501446249999999	FD	2	0
75		1	0	R	1	0	E	1	0.33185000000000003	S	1	0.48708	G	1	0.62604	D	1	0.75351	P	1	0.97298	Q	1	2.2245566666666665	L	1	3.647933166666667	F	1	7.562548333333334	TF	2	0.9119200000000001
76		1	0	V	1	0	S	1	0.56907	Q	1	0.8455146666666667	R	1	1	L	1	1.3297266666666667	P	1	1.3332700000000002	K	1	2.9360533333333336	T	1	7.270759083333334	KTL	3	0.9355600000000001
77	N	1	0		1	0	Q	1	0.02397	D	1	0.82136	P	1	0.866664	L	1	14.590459500000003
78	S	1	0		1	0	G	1	0.3332333333333333	M	1	0.748095	V	1	0.864252	L	1	0.98479	Y	1	0.99978	N	1	1.3143566666666666	K	1	9.108165333333334
79	V	1	0	A	1	0		1	0	L	1	13.165436416666669	SL	2	0.3094283333333333
80		1	0	V	1	0.33214333333333335	E	1	0.93081	A	1	1.18738	G	1	1.50379	S	1	5.664647333333333
81		1	0	L	1	0.46064	K	1	1.0832066666666667	GL	1	1.8156937499999999	R	1	5.65847
82		1	0	L	1	0.44108	R	1	2.2708525	V	1	11.949423333333334	LD	2	2.5156183333333333
83	M	1	0		1	0	D	1	0.10022	T	1	0.30293	F	1	1.3328366666666667	E	1	10.526386666666667
84	Y	1	0		1	0	M	1	0.33629	S	1	0.48743	L	1	0.99942	P	1	3.1349725	T	1	11.803886666666667
85		1	0	Y	1	2.6187775	E	1	12.849593333333331
86		1	0	P	1	0.99912	D	1	18.476000833333334
87		1	0	T	1	0.92809	L	1	1.67063	V	1	16.760074166666666
88	H	1	0.82342	G	1	18.143333333333334
89	G	1	0.66558	R	1	0.89739	T	1	17.922205833333333
90	A	1	0.98096	T	1	0.99958	Y	1	17.506765
91	M	1	0.09945	C	1	0.97689	Y	1	17.406108333333332
92	Y	1	0.27979	T	1	0.68186	D	1	0.76161	H	1	0.99404	M	1	1.55457	A	1	1.8918499999999998	S	1	3.96056	C	1	5.121453611111112
93		1	0	A	1	0.03227	N	1	0.62173	D	1	0.86522	P	1	0.9942	C	1	1.0683799999999999	E	1	1.79719	M	1	8.547616944444444
94		1	0	V	1	0.06879	R	1	0.43768	GA	1	0.600965	T	1	0.6528	M	1	2.72093	Q	1	9.348490753968255
95	E	1	0.3118	D	1	1.6259700000000001	G	1	13.610091746031745
96	D	1	0.25981	E	1	0.54178	P	1	0.78022	S	1	1.2067758333333336	V	1	1.8998	R	1	11.762358095238097
97		1	0	D	1	0.31646	A	1	0.5016	Y	1	0.8356	Q	1	1.00535	R	1	1.7677230555555554	S	1	1.92656	E	1	10.22872657142857
98		1	0	V	1	0.10735	D	1	0.15303	E	1	0.7787680555555556	T	1	1.70708	S	1	13.690866095238096
99		1	0	G	1	1.84397	P	1	16.34564173809524
100		1	0	M	1	0.77495	AM	1	0.851145	F	1	1	S	1	1.6246116666666666	W	1	12.460843388888888
101		1	0	T	1	35.2426502631579
102		1	0	F	1	35.29437302005014
103	Q	1	0.28476	W	1	0.99805	F	1	0.9987	G	1	37.087062807017546
104	E	1	0		1	0	S	1	0.4988975	F	1	0.77138	Q	1	31.582275273182955
105	S	1	0.3314533333333333	G	1	34.12752313909775	TG	2	1.74678	SA	2	3.811365
106	G	1	0.15514333333333333	D	1	0.46984	H	1	0.61321	S	1	0.70512	Y	1	0.96152	T	1	27.32320334210526
107	L	1	0.49384	P	1	0.49998750000000003	AV	1	0.83336	Q	1	0.95659	D	1	0.97491	E	1	1.36486	K	1	32.854142393483706
108	L	1	0.05075333333333334	K	1	0.09923	V	1	31.82315323934838
109	N	1	0.99567	D	1	30.223954348370928
110	N	1	0.31237	R	1	0.3599	D	1	0.49333000000000005	V	1	0.77522	W	1	0.79803	K	1	3.31991	L	1	25.6252619047619
111		1	0	M	1	0.39526	V	1	0.99888	N	1	0.99948	G	1	1.46113	L	1	1.7820233333333335	K	1	21.728045701754386
112	T	1	0	L	1	0.08485	N	1	0.63419	E	1	0.85768	K	1	1.058	V	1	2.3792400000000002	R	1	14.786692017543857
113	L	1	0.39917	D	1	0.4019675	V	1	0.76217	A	1	0.78524	F	1	0.93998	N	1	1.13987	T	1	1.5951620000000002	G	1	2.44192	S	1	7.35413350877193	TV	2	2.4765042307692307
114	T	1	0.011698	D	1	0.12389	S	1	0.29116	N	1	0.33493	G	1	1.61459	L	1	7.356973388157895
115	P	1	0		1	0	V	1	0.36532	L	1	0.48611	A	1	11.501491133097167
116		1	0	L	1	0.87498375	F	1	0.87777	T	1	0.98418	A	1	11.269998684210528	PSA	3	0.39653133333333335
117	F	1	0	S	1	0	L	1	0.33024666666666663	V	1	0.67395	A	1	1.874585625	P	1	12.617487624831309
118	Q	1	0.006556666666666666	C	1	0.3333333333333333	K	1	0.874978125	E	1	0.98488	A	1	0.99812	F	1	0.99998	V	1	1.2001400000000002	S	1	7.081344082321188	VS	2	0.5891850000000001
119	P	1	0.3333333333333333	T	1	0.82435	N	1	0.99943	V	1	11.751439942645073
120	M	1	0.331302	A	1	0.3333333333333333	L	1	0.3333333333333333	D	1	0.99975	F	1	13.1310992689814
121	F	1	0.3333333333333333	P	1	0.9947	V	1	1.19169	L	1	5.921550276829196
122		1	0	Q	1	0.3323466666666667	P	1	0.6	E	1	0.99955	F	1	8.14947023616734
123	N	1	0	G	1	0	H	1	0	D	1	0.3333333333333333	S	1	0.6	P	1	9.067740163116822
124	T	1	0	V	1	0.3333333333333333	E	1	0.3333333333333333	A	1	0.6	S	1	0.97445	P	1	8.715164360147861
125		1	0	E	1	0	M	1	0	L	1	0.8252533333333334	S	1	9.299195291321952
126		1	0	N	1	0.01819	V	1	0.9966	D	1	9.927117923546325
127		1	0	K	1	0	A	1	0.22195	S	1	0.3333333333333333	E	1	9.862833324825441	QE	2	0.6398550000000001
128		1	0	L	1	0.3333333333333333	A	1	0.42752	AG	1	0.7632749999999999	M	1	0.93556	Q	1	7.658652398932112
129	A	1	0.3333333333333333	V	1	0.97796	P	1	0.99697	L	1	13.290560723097462	KL	2	3.8087180000000003
130	Q	1	0	L	1	0.73536875	R	1	0.75543	A	1	0.99986	G	1	0.99999	F	1	1.30291	K	1	8.700011464824268
131	C	1	0	Q	1	0.3296766666666667	G	1	0.89547	A	1	0.99152	L	1	1.89617	T	1	6.063253333333334	S	1	33.229044995283026	GS	2	0.890995
132	T	1	0.2776133333333333	S	1	0.34789	C	1	0.99605	A	1	3.513081422955975	E	1	4.067443333333333	Q	1	5.633993333333333	G	1	20.45404366666667	AS	2	5.200102
133	K	1	0	A	1	0.07665999999999999	Q	1	0.24167	N	1	0.3171933333333333	L	1	0.31762	E	1	0.93041	G	1	0.99702	D	1	1.94742	S	1	4.61622	T	1	27.111076330188684
134		1	0	G	1	0.05722333333333333	N	1	1.42768	V	1	6.66528	A	1	40.0336595120545	GT	2	1.8436949999999999	VGT	3	1.94796
135		1	0	N	1	0.1046	F	1	0.24136	G	1	0.99959	L	1	1	E	1	2.2679333333333336	S	1	43.159768776729564
136	R	1	0.68196	D	1	0.77086	L	1	2.3291033333333333	G	1	5.7851560409699	A	1	7.00327	F	1	7.220074921383649	V	1	33.11379513888889
137	R	1	0.2046	K	1	0.87873	S	1	0.99655	N	1	1	G	1	1.62802	L	1	1.8207066666666665	P	1	1.83617	V	1	44.420196065496114	AM	2	0.42413500000000004	CV	2	0.997785
138	M	1	0		1	0	H	1	0.17894	R	1	0.94061	P	1	0.99903	F	1	1	A	1	1.21868	D	1	1.3119033333333334	T	1	1.3644699999999998	G	1	1.75467	V	1	1.7851	K	1	1.9988299999999999	S	1	3.9924100000000005	L	1	5.951468681716833	C	1	24.66389638888889
139		1	0	E	1	0.00728	N	1	0.31221	F	1	0.51459	Q	1	0.56503	A	1	0.77302	H	1	0.87037	D	1	0.93176	C	1	1	V	1	1.96119	L	1	37.013371540133775
140		1	0	M	1	0.28289	Y	1	0.33054333333333336	Q	1	0.39383999999999997	T	1	0.41838	N	1	0.71151	E	1	0.97057	G	1	0.99997	R	1	1.2594966666666667	P	1	1.3203233333333333	S	1	1.99892	H	1	2.67077	L	1	34.44202287625418	VAG	2	0.98854
141		1	0	Y	1	0.26207	L	1	0.78188	GG	1	0.842835	R	1	0.90084	T	1	0.90532	Q	1	0.99465	V	1	1	E	1	1.45595	D	1	11.535768166666667	N	1	26.416431756317362
142		1	0	S	1	0.3309166666666667	F	1	0.99836	L	1	1.26117	E	1	1.97736	M	1	1.98729	P	1	1.99099	G	1	2.99985	D	1	4.132326666666667	GG	1	4.689509999999999	N	1	24.24097296256038	FN	2	0.7030350000000001
143		1	0	E	1	0.14811	Y	1	0.16068	L	1	0.30016	D	1	0.31999666666666665	Q	1	0.33292	S	1	0.47368999999999994	M	1	0.6969000000000001	A	1	0.79162	V	1	0.80543	G	1	0.9037	H	1	0.96882	K	1	0.99766	W	1	0.99893	N	1	1	T	1	2.5017176811594206	P	1	2.91008	F	1	21.784166333333335	YF	2	0.45146
144		1	0	D	1	0.46697	M	1	0.61808	R	1	0.64361	G	1	0.85513	E	1	0.94979	Q	1	0.97926	S	1	1	C	1	1	A	1	1.5715941666666664	H	1	2.9232899999999997	Y	1	27.856568833333338
145		1	0	M	1	0.17854	V	1	0.3719	N	1	0.95233	S	1	0.98007	Q	1	0.9926	C	1	0.99267	L	1	1	F	1	1.2325	P	1	31.419082499999995	RP	2	0.520485
146		1	0	D	1	0.30848	E	1	0.51063	T	1	0.98277	GL	1	0.99146	N	1	1	S	1	1.3786100000000001	Y	1	1.39303	A	1	1.5787	R	1	26.21537283333334	ER	2	0.395745
147		1	0	V	1	0.87136	P	1	1.93811	R	1	2.28224	E	1	5.747529999999999
148		1	0	N	1	0.18285	L	1	0.24839	M	1	0.44964	T	1	0.95193	A	1	24.14609075524475
149	H	1	0.60844	K	1	1.02612	L	1	22.918702090909093
150		1	0	V	1	29.197516738261736
151		1	0	P	1	0.80512	M	1	0.87234	L	1	0.99949	D	1	1.4496575	Q	1	11.018176428571428	N	1	15.816408524475525
152	A	1	0.4851669230769231	S	1	1.17351	D	1	1.2415533333333333	N	1	1.48983	E	1	1.6806342857142857	Q	1	1.948079047619048	G	1	2.16535	W	1	16.668449803030303
153		1	0	W	1	0.1893733333333333	D	1	0.40252	H	1	0.8587	N	1	0.91727	P	1	0.99998	V	1	1.9089999999999998	M	1	2.02184	Q	1	2.324533076923077	K	1	11.627493809523811	VK	2	0
154	W	1	0	T	1	0.4801	H	1	0.95464	A	1	0.9888	S	1	1.553964523809524	L	1	1.7442600000000001	Y	1	1.7680500000000001	V	1	22.743976419413922
155	S	1	0.21961999999999998	C	1	0.3964	T	1	0.4903	H	1	0.61759	A	1	0.62612	G	1	0.99853	L	1	0.99952	Y	1	1.981716428571429	E	1	5.462362166666667	Q	1	6.188376666666667	D	1	14.969835238095236
156	W	1	0	V	1	0	Y	1	0.10164	T	1	0.3074966666666667	E	1	0.44858	D	1	0.637025	H	1	0.97526	S	1	0.99888	P	1	1.3333033333333333	M	1	1.4002999999999999	A	1	1.9983	Q	1	7.727676576923076	N	1	11.679465952380953	GQ	2	2.721545
157	H	1	0.01939	L	1	0.32789	W	1	0.4326	V	1	0.47104	D	1	0.56743	R	1	0.96679	G	1	0.98079	M	1	0.99229	Q	1	1.11453	T	1	9.412949358974359	A	1	10.467522857142857
158	T	1	0.9762	A	1	1.71867	L	1	34.065894853479854
159	S	1	0.56181	A	1	0.89609	L	1	0.98498	N	1	0.99968	V	1	0.99977	AA	1	1.9918049999999998	C	1	1.9973800000000002	Q	1	18.208811428571426
160	E	1	0	K	1	0.3252466666666667	V	1	0.83096	C	1	0.96363	G	1	0.98124	P	1	0.99999	T	1	1	A	1	1.95874	N	1	3.18103	S	1	14.197757619047621
161		1	0	D	1	0.71381	P	1	0.98119	S	1	0.99699	V	1	0.99999	A	1	1	G	1	16.42966571428572
162	F	1	0.16584333333333331	E	1	0.49152	K	1	0.96591	L	1	0.99896	P	1	0.99902	GG	1	1.040195	A	1	1.67132	V	1	1.96472	D	1	2.77259	N	1	10.524919047619047
163	G	1	0.14575	Q	1	0.59827	Y	1	0.99864	P	1	0.99997	T	1	1	E	1	1.27402	V	1	1.99746	S	1	18.647394285714284
164	T	1	0	E	1	0.65792	M	1	0.98118	L	1	0.99564	V	1	0.99998	P	1	1	G	1	4.236293333333333	Q	1	14.617993809523808
165	P	1	0.41681	H	1	0.74478	Q	1	0.8036	S	1	0.88392	A	1	0.99993	T	1	0.99995	G	1	1	W	1	1	L	1	1.3319933333333334	D	1	1.72546	V	1	3.90099	E	1	11.443354285714287
166	D	1	0.47152	E	1	0.91518	T	1	0.95	Q	1	0.98824	R	1	1	V	1	2.53077	G	1	2.80793	S	1	16.305501904761904
167	Q	1	0.34586	L	1	0.99865	E	1	0.99904	S	1	0.99907	P	1	1	V	1	17.7886780952381	LS	2	0.99992
168		1	0	D	1	0.9587	F	1	0.98334	S	1	0.99988	P	1	0.99997	T	1	18.94878761904762
169	L	1	0	Q	1	0	C	1	0.43703	V	1	0.57152	H	1	0.97981	A	1	0.99659	Y	1	0.99867	D	1	0.99888	F	1	0.99985	T	1	1	E	1	17.177741904761902
170	F	1	0	P	1	0	D	1	0.54119	N	1	0.99974	Y	1	0.99989	E	1	1.61055	Q	1	17.754873333333336	NE	2	0.28125	EN	2	0.973385
171	T	1	0	K	1	0	N	1	0.06370999999999999	F	1	0.33320333333333335	E	1	0.46672	G	1	0.99873	V	1	3.98301	D	1	13.559353333333332
172	E	1	0.12435	K	1	0.63426	D	1	0.91143	Q	1	0.96328	V	1	1.9965899999999999	S	1	26.123106238095236
173		1	0	V	1	0.21123	Q	1	0.46507	Y	1	0.74276	L	1	0.88771	H	1	0.98606	R	1	0.99459	N	1	1.1261656666666666	VA	1	1.9994100000000001	K	1	19.84984214285714
174	A	1	0	L	1	0	F	1	0		1	0	N	1	0.00525	V	1	0.23344	E	1	0.96549	W	1	0.99949	P	1	0.99999	S	1	1.97088	G	1	1.99885	Y	1	3.8023766666666665	D	1	13.050678469696969
175	F	1	0		1	0	D	1	0.26814	N	1	0.7931266666666666	V	1	0.81694	A	1	0.96661	K	1	0.99545	G	1	1.11109	L	1	1.6797246666666668	E	1	1.86815	S	1	16.83242485479798
176		1	0	K	1	0.5138355555555556	M	1	0.51678	L	1	0.78951	F	1	0.99434	S	1	1.6664316666666665	V	1	1.92527	N	1	2.28909	D	1	2.71034	T	1	17.669755018939394
177		1	0	S	1	0.19922	E	1	0.96572	D	1	0.99681	A	1	1.59762	G	1	2.3578675000000002	L	1	10.783068333333334	Y	1	16.592332006313132
178		1	0	N	1	0.14841	M	1	0.75653	Q	1	0.99671	E	1	1.4926599999999999	S	1	9.886237390151516	T	1	14.278109222222222
179		1	0	G	1	1.9750299999999998	L	1	27.87623844570707
180		1	0	E	1	0.9741	G	1	1.21301	T	1	1.3280833333333333	D	1	1.98172	L	1	2.49374	S	1	9.789753693181819	N	1	10.390800777777775
181		1	0	D	1	0.72843	G	1	0.91034	T	1	0.99701	A	1	1	E	1	1.61505	L	1	2.2109466666666666	N	1	11.328645777777776	S	1	13.448612727272728
182		1	0	M	1	0.38258	G	1	0.4578025	L	1	0.4993925	W	1	0.89203	S	1	0.99883	F	1	1	A	1	1.54895	N	1	3.4411716666666665	D	1	8.676637444444445	T	1	9.062551875
183	N	1	0.3320133333333333	D	1	0.38413	S	1	0.5	V	1	0.64582	E	1	0.97754	A	1	0.98752	Y	1	0.99997	L	1	27.956169184343437
184	V	1	0	Q	1	0		1	0	P	1	0	A	1	0.49999499999999997	C	1	0.99959	L	1	0.99968	D	1	1.3200766666666668	H	1	1.4619974999999998	K	1	2.98216	T	1	32.58221825252526
185	Q	1	0	E	1	0.4524475	D	1	0.495185	S	1	0.5	N	1	0.99591	K	1	0.998	L	1	36.843947040404046
186	D	1	0		1	0	T	1	0.33283333333333337	Y	1	0.96687	K	1	0.9972	V	1	1.4781225	C	1	1.499965	Q	1	1.99802	E	1	2.152225	S	1	13.728313443181817	L	1	16.057715777777776
187		1	0	W	1	0	N	1	0	A	1	0	T	1	0	G	1	0.62718	K	1	26.590245265151513
188		1	0	G	1	0.94792	S	1	1.16246	L	1	1.3292599999999999	K	1	2.4775925	A	1	7.350015606060606
189		1	0	N	1	0	L	1	0.33257	Q	1	0.84753	A	1	0.85358	D	1	0.8808406666666666	H	1	1	E	1	1.1676600000000001	Y	1	4.8020925000000005
190	G	1	0	M	1	0.57318	E	1	0.5915	W	1	0.86716	C	1	1	D	1	2.52699	Y	1	3.030395166666667
191	R	1	0	A	1	0	S	1	0.5	D	1	0.8277100000000001	Y	1	0.95478	E	1	2.1005668333333336	GVT	2	1
192	Q	1	0.03288	L	1	0.498745	T	1	0.5	K	1	5.347334666666666
193	A	1	0.49146500000000004	P	1	0.5	D	1	1	H	1	8.831472
194	G	1	0.5	C	1	1	K	1	9.300770333333332
195	Y	1	0.53141	V	1	26.421246156862747	YV	2	2.717315
196	F	1	0.49039999999999995	P	1	0.99458	V	1	2.99796	Y	1	23.147377764705876
197		1	0	N	1	0.09182	E	1	0.91478	V	1	0.9745866666666667	S	1	0.99509	G	1	1.3489200000000001	M	1	1.99378	A	1	19.472128904977374	CA	2	0.85318
198	T	1	0.37173	S	1	0.51966	Y	1	0.85018	L	1	1	E	1	1	A	1	1.16911	D	1	1.3706266666666667	G	1	4.29233	C	1	11.568384739064859
199	M	1	0.09993	A	1	0.25378666666666666	N	1	0.27355	C	1	0.6223799999999999	S	1	1	D	1	1.3012233333333334	E	1	16.09121390950226	DL	2	0.48207
200	L	1	0.09807	A	1	0.11674	C	1	0.26645	M	1	0.29527	E	1	0.3753266666666667	N	1	0.53123	Y	1	0.5719166666666666	F	1	1.2680099999999999	V	1	13.758175024132733
201	W	1	0.1926075	A	1	0.3399	G	1	0.94149	M	1	1	D	1	1.94468	T	1	25.060155586727
202	V	1	0		1	0	K	1	0.94541	T	1	0.98873	D	1	1	H	1	26.977179006033182
203	L	1	0	C	1	0.3156975	E	1	0.51825	AG	1	0.77746	V	1	0.95219	T	1	0.99189	Q	1	26.30510946304676	GQ	2	0.5462400000000001	AN	2	0.594895
204	A	1	0	Q	1	0.14247	S	1	0.99775	G	1	27.61987508446456	VA	2	0.339511	AV	2	1.450105
205	E	1	0.19987	K	1	0.57321	P	1	0.65451	V	1	0.9441	S	1	2.99731	L	1	25.35695002413273	SL	2	0	VT	2	0.4660425
206	G	1	0	L	1	0.9978	E	1	1.11365	T	1	1.3196400000000001	S	1	29.143913693169583
207		1	0	E	1	0.96124	A	1	0.97283	V	1	0.99906	G	1	0.99994	L	1	1.02043	T	1	2.780380833333333	S	1	23.248762318465847
208		1	0	D	1	0.12911	A	1	0.76403	W	1	0.99997	E	1	1.28744	L	1	1.99981	P	1	28.190811103210518
209		1	0	G	1	0.54594	M	1	0.99903	Q	1	0.99945	Y	1	0.99972	K	1	1.4255499999999999	A	1	2.99852	V	1	24.01582113122172	SL	2	0.50835
210		1	0	A	1	0.3298466666666667	N	1	0.99974	D	1	2.43308	T	1	26.384367377720316
211		1	0	A	1	0.89636	H	1	0.91213	R	1	0.92923	N	1	0.95822	GL	1	0.958585	V	1	0.98463	E	1	0.99722	S	1	0.99853	G	1	0.99932	K	1	21.959876459814694
212		1	0	V	1	0.33253666666666665	E	1	0.41348	T	1	0.43431	R	1	0.95448	A	1	0.97408	D	1	0.98834	S	1	7.5436885714285715
213	N	1	0	L	1	0.22451	M	1	0.66557	G	1	0.99842	S	1	0.99988	F	1	8.129208571428572	GF	2	0.8349150000000001
214		1	0	M	1	0.28665	R	1	0.83001	N	1	0.92446	Y	1	0.99855	L	1	1.73795	G	1	2.83554
215	G	1	0	L	1	0.44025	S	1	0.99247	R	1	7.23071
216	A	1	0	M	1	0.17717	S	1	0.61709	N	1	1.92488
217	K	1	0	Y	1	0.28856	C	1	0.29565	E	1	1.14851
218	R	1	0.32296	C	1	2.86138

Variant Graph

Determine stroke width:

LocalGlobal

Higher Order Variant Graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

1st order support

Higher order graph

Depth of Coverage of the Consensus Sequence

Label	Value
"0"	30.2
""	30.7
""	36.2
""	41.4
""	38.5
""	31.9
""	38.6
""	47.3
""	40.3
""	48.8
""	45.3
""	48.9
""	42.4
""	47.8
""	51.3
""	48.9
""	41.3
""	52.1
""	46.9
""	55.5
"20"	52.9
""	48.6
""	46.5
""	43.8
""	26.8
""	27.2
""	24
""	28.5
""	26
""	28.4
""	23.7
""	22.2
""	17.1
""	17.8
""	13.8
""	29.4
""	32.8
""	22.2
""	23.9
""	17.3
"40"	23
""	26.7
""	28.1
""	29.3
""	29.7
""	20.4
""	31.8
""	36.9
""	36.9
""	44.6
""	57.5
""	66.5
""	65.1
""	62
""	65.5
""	55.4
""	46.5
""	50.2
""	48.6
""	26.5
"60"	22.7
""	25.1
""	22.8
""	25.9
""	28.1
""	21.2
""	18
""	17.2
""	18
""	18.1
""	17.8
""	17.2
""	15.9
""	18.2
""	14.6
""	17.5
""	16.2
""	16.3
""	14.4
""	13.5
"80"	9.62
""	9.02
""	17.2
""	12.3
""	16.8
""	15.5
""	19.5
""	19.4
""	19
""	19.5
""	19.5
""	18.5
""	15.2
""	13.9
""	13.8
""	15.5
""	16.5
""	16.6
""	16.4
""	18.2
"100"	16.7
""	35.2
""	35.3
""	39.4
""	32.9
""	40
""	30.2
""	38
""	32
""	31.2
""	31.7
""	27.4
""	19.8
""	18.3
""	9.73
""	12.4
""	14.4
""	15.5
""	13.1
""	13.9
"120"	15.1
""	8.44
""	10.1
""	10
""	11
""	10.1
""	10.9
""	11.1
""	10.1
""	19.4
""	13.5
""	44.3
""	40.5
""	36.6
""	52
""	47.8
""	56.9
""	54.2
""	47.2
""	43.9
"140"	46.8
""	45.1
""	45.3
""	36.5
""	38.9
""	38.6
""	34.8
""	10.8
""	26
""	24.6
""	29.2
""	31
""	26.9
""	21.3
""	30.2
""	33
""	30.3
""	25.8
""	36.8
""	26.6
"160"	24.4
""	21.1
""	21.6
""	25.7
""	23.5
""	25.3
""	26
""	23.1
""	22.9
""	24.2
""	23.2
""	19.4
""	30.8
""	27.3
""	24
""	25.3
""	29.1
""	33.5
""	27.6
""	29.9
"180"	28.2
""	32.2
""	27
""	32.8
""	40.8
""	40.3
""	39.2
""	27.2
""	13.3
""	9.88
""	8.59
""	5.38
""	6.38
""	10.8
""	10.8
""	29.7
""	27.6
""	26.6
""	22.1
""	20.1
"200"	17.3
""	29.5
""	29.9
""	31
""	30.5
""	31.2
""	32.6
""	31
""	33.4
""	32.5
""	30.1
""	30.6
""	11.6
""	11.9
""	7.61
""	8.66
""	2.72
""	1.73
""	3.18

Scores

Length	Score	Matches	Unique Score	Unique Matches
219	4.527E+04	666	2.866E+04	329

Order

IGKV2-28 → IGKJ1 → IGKC

Alignment

10 20 30 40 50 60 70 80 90 100 110 120 130 140 150 160 170 180 190 200

DFVLTQ-SP-HSLSVT-PGESASI--SCKSSHSL-LHGDGHNYLFW-YVQK--P-G-QSPQL-LI-D-L-ASER-ASGVPDRFS----GSGSDKDFTLKISRVEPE-DVGTYYSMQGRQTPW-TFGQGT--K--VD-I-KRSLAA--PSVFI--FPPS-DEQLK-SGT-AS-VVC-L--L--NNFY-PRE---ALVQWKVDNA-LQSGNSQESVTE-QDSK-DSTY-SLSS--TL-TLSK--AYYEKHKVYA-C-E-V--THQGLSSP-VT-KSFGRNEC

VDNA-LQSGNSQESVTE-QDSK-DSTY-SLSS--TL-TLSK SEQH-LQ-D-F---EG-AVVVAGEFD----Q-GS-KDST L-KE-G-M-LCAG-ASGV----S----SCGCDKLPSDKL KG-GSYVQ-DM-E-G-AVVV-SAGEFDQ------GSSSEK VQWKVDNA-LQGDDGQESVTE-QDSK-DSTY EPAT----GSGSRYDDT------------GTAY KGEEEEVVTC-EVVVA-GEFD-QGSS--TD-KLQK--L SEQH-LQ-D-F-W----AVVVAGEFD----QGSSSKE STW-KLKDAEL---CAQSQSS-CMGDGSGPL SEQH-LQ-D-FWAGVV-VAGEMDQ------GSSSEK Q-SP-LSLSVT-PDPM-----SLPTYHELHLHG Q-SP-LSLSVT-P--SAAD--LSPEYHTLHLHG KLDAM-LCAGASGVSS-E-EDDK-VLDA-M DFVLTQ-SP-HSLSVT-PDSSASS--SMESS DFVLTQ-SP-HSLW-T-PGESASL--SYEM DFVLTQ-SP-HSLSVT-PADSASL--GGGF KAAEQ-LQSGGGSQESVTE-QDSK-DSTY KVDGQ-LQSGNSQESVTE-QDSK-DSTY KVGNQ-LQSGNSQESVTE-QDSK-DSTY KVDGQ-LQSGNSQESVTE-QDSK-NSTY KLDGQ-LQSGGGSQDGQTE-QDSK-DSTY LGT-WLKDAS--SLCAQSQSS-CMGDSGGPL DLVLSQ-TP-LSLSVT-PGESASL--SCK LTL-YD---LAHT-PGVAADL--SHLETK DLVLTS-QP-LTVSVT-PGEGTSL--CSK DLVLTS-QP-LSLSVT-PGEGTSL--SCK LTA-DY---LLHT-PGVAADL--SHLETK DLVLVE-SP-TLLGHT-PGESASL--SCK DLVLTQ-SP-LSLSVT-PGESASL--SCK AS-VV---------------E---ALVLDQVEAR DLVLTQ-SP-AQLSVT-PGEGTSL--SCK DLVLTS-QP-LTVSVT-PADSASL--SMN DLVLTS-QP-LSLSVT-PGESASL--CSK DFVLTQ-SP-HSLW-T-PADSASL--SCK DFVLDQ-Q--HQLSVT-PGESASL--SCK DFVLDV-DG-HKVSVT-PGESASL--SCK DFVLGE-EP-SHLSVT-PGESASL--SCK FDVLGE-SP-HSLDAT-PGESASL--SCK DFVLTQ-SP-HSLSVT-PADSASL--NGF DFVLT-NTP-SHLSVT-PGESASL--SCK DFVLEA-DG-HKLSVT-PGESASL--SCK KSGPDVTE-EVVVA-DAME-NGSS--SE-KLQ DFVLTQ-SP-HSLSVT-PGESASL--SCK VDGQKLQSGNSQESVTE-QDSK-DSTY VVP-A--L--N------P---AL-QWPVLSG-L ETVSE-ENSV-------------L-CLSK LKDGQ-LQSGNSQDGQTE-QDSK-DSTY KDNA-LQN-NSQESVTE-QNSHVEET AAALGLDLGTTYSMQGV-------FQGH--K AHCGVTDCVVG-L-S-V--MDQGSSSE-K MEVLTN-SP-HSLSVT-PGESASL--SCK HDDD-TSSDVVVAGEFD-QGSK-DST SLDL-SL-D-L-AEVK-AQMEMLAQK MLQVSPYQVSVPY-QVS---SNG-S A-C-EAV--TVLALGSA-V---SNGGAK GVVD----------SD-DLPLNVSR SLDL-SL-D-L-AEVK-AQMMELAQK KVDNA-LQSGNSQESVTE-QNSK SLSVT-PGESASL--HGHTGPGE-L VDNA-LQSGNSQESVTE-QDSK VDNA-LQSGNSQESVTE-QNSK SVT-PGESAS-------SHMT-PA -VLDQ-DC-LMLS----GETAK VDNA-LQT-NSQESVTE-QDSK GTGEFDAFDAFDQGSSSEKLQKL AL-VNF-C--L--NENS---E---ALVNW Q-SP-LSLSVT-P--ECYL--SCK Q-SP-HSLSVT-PGESASL--SCK LDNA-LLSGNSQESVTE-QNSK Q-SP-LSLSVT-PGEGTSL--CSK GTGVMT-FD----KDQDDKDGTL Q-SP-LSLSVT-PGEASSL--CSK HKVPA-S-E-NMETHQGLSSP-VT-K Q-SP-LSLSVT-PMSSM-L--SCK AA--LQPAL--QPV-----LK-SGL Q-SG-FSLSVT-PYGH-SL--SCK Q-SP-LSLSVT-PGESASL--SCK SLAA--PSVFL--FPPS-NEQLK SLAA--PSVFL--FPPS-DEQLQ TSDVVVADAFDQ---GSTSDKLQKL LGLRDPY-DVGTYYCMQGR SLAA--PSVFL--FPPS-DEQLK TVAA--PSVFL--FPPS-DEQLK TVAA--PVTFV--FPPS-DEQLK LGRVEPY-DVGTYYSMQGR SQT-VS-AVC-L--H--RPTD-MEE---M SN-DLTY--LTL--NN-DLTK--LL LLVDEA-LNEDNSVVSLSQ-PK SLAA--PVSFL--FPPS-DEQLK DNYLAW-YVQK--P-G-RPAWA-LL VQK--P-S-GRPAGL-LL-Y-L-GTSR DSK-DSTY-SLSS--TL-TLSK--A SPQL-LL-D-G-------SQVGK SLSVT-PGESAGP--LHQESH TVTVS-PGESASL--HTHSSH MLQVSPYQVSVPY-QVSN-GS SLSVT-PGESASL--SHTHSH SLSVT-PGESATL--SHHSSH SLAFLMPSVFL--FPPS-DEQLK SLAA--PSVFL--FPPS-DQELK TVAA--PSVFL--FGVM-DEQLK LLVDEALG-GED-NS-VVS-L--S--QPK SLAA--PVTFV--FPPS-DQELK VY--C-E-L--THQGLSSP-VT-K ESPW-TFGQSA--K--VD-L-KVG VYA-D-N-YM-THQGLSSP-VT-K VETE-DVGTYYDDRDPAD PGE-FSLSVT-PGYSLSG--GHY QSPW-TFW-GT--K--VD-L-KVG EKY-DGTL-TLNN--DL-TLLK DSK-YNSL-TLNN--DL-TLLK SLSVT-PGESASD--SGPHM VYA-A-C-V--THQGLSSP-VT-K KEQLF-QEN-GE-LVD-L--R--NDF SL----PSVFPSVFPPSVDEQL VYA-C-E-V--THQGSSLP-VT-K VYG-D-M-V--THQGLSSP-VT-K L-LA-P-V-AEE--AETVPNNK YVC-A-E-V--THQGVSTP-VT-K VYV-C-A-E--THQGLSSP-VT-K SGT-AS-GVH-H--Q--DLHG-PYR VYA-S-E-NY-THQGLSSP-VT-K VYA-C-E-V--THQGSLSP-VT-K VYA-A-E-M--THQGLSSP-VT-K VYG-YY-DL--THQGLSSP-VT-K AE-QDSK-GDD---LST--AL-LK L-LL-D-L-ASEN--SLRPDRF L-LA-P-V-AEEE-AT-VPNNK VYAGC-C-Y--THQGLSSP-VT-K YVE-D-E-M--THQGLSSP-VT-K VYA-GSE-M--THQGLSSP-VT-K L-LL-D-L-ASE--TGRRPDRF L-LL-D-L-AT-R-DNVTPDRF YVM-G-D-V--THQGLSSP-VT-K L-LL-D-L-ASER-GKE-PDRF L-LL-D-L-ASER-NVT-PDRF VYM-G-D-V--THQSKE-P-VT-K VYV-C-E-A--THQGLSSP-VT-K DNYLAW-YVQK--PVG-RVPEL-L VETE-DVGTYYH--GDYT VYS-A-E-E--THQGLSSP-VT-K VYA-D-D-YM-THQGLSSP-VT-K VYA-T-D-CY-THQGLSSP-VT-K SRLMYY-DVGTYYCMQGR VYA-C-E-V--THQGLSSP-VT-K VYYN-S-M-V--THQGLSSP-VT-K SS--TS-TSS-----YSTPGVY SGT-AS-VVS-Q--L--TMQR-PY SGT-AS-VVS-E--L--NGGFY-PR TGT-AS-VVCHL--L--NGGFY-PR SLSVT-PGESASL--THEC KPAE---ALVNSMVQQT-LAAN SGT-AS-VVC-L--L--DGGFY-PR TGS-AS-VVC-L--L--NNYM-PR NSK-YSDL-TLDN--NL-TLLK VDVVADAFDQ---GSSSEKLQKL SAS-AS-VVS-D--L--DGPHMPR DSQWVVDE-DDSQ-WVVS SGT-AN-AVC-L--L--NNFY-PR SGT-AS-VVA-Q--Q--NNFY-PR AGLF-LEG-NE-LVD-L--R--NDF GSS-AS-LVC-L--L--NNFY-PR TSDVVVA-G-E-F--DKEAVSTD-VD SAS-AS-VST-L--L--DGPHMPR TSGT----VVC-L--L--DGPHMPR SGT-AS-VVC-L--L--DLMY-PR GST-AS-VVG-DDHL--NNFY-PR NSK-YSNL-TLDN--NL-TLLK SGT-AS-VVT-L--L--NNFY-PR SGT-AS-VVC-L--L--NDFY-PR SAS-AS-VVC-L--L--NNFY-PR SAS-AS-VVC-L--L--NGGFY-PR TGS-AS-VVC-L--L--DGGFY-PR SGT-AS-VVC-L--L--DNFY-PR TGS-GT-VVC-L--L--NNFY-PR VETE-DVGTYYMATGVD TGS-AS-VVC-L--L--NNFY-PR NSK-YSDL-TLNN--DL-TLLK NSK-YSNL-TLNN--DL-TLLK YV-C-E-L--THQGLSSP-VT-K LREQLQSGNSQESVTE-QNSK LL--GSGLSSSSV-LHGMVFK QSK-FSDL-TLNN--DL-TLLK SGT-AS-VVC-L--L--DNFY-RP RVTMYYDVGTYYCMQGR SLSVT-PGESASL--ENHM ESPW-TFGQGT--K--VD-K-LR SAS-AS-VVC-L--L--DMLY-PR TG-ELLS--GL-HLEA--LYGR SGT-AS-VGR-F--M--GGGGFY-PR GGGGGFSLSVT-PGESASL--SYEM DGEE-AVLVPG--S----GPGSW ESPW-TFGQSA--K--VD-L-KR VGLREPY-DVGTYYCMQGR QAA--PCVLF--FDEL-DSLAK TGS-AS-VVC-L--L--DGGYF-PR SLSVT-PGESASL--MGCY ESPW-TFGQGT--K--VD-L-KR GVPVRDP----ATGYTLEFR VGLREPY-DVGTYYSMQGR ESPW-TFGQGTG-K--VD-L-KR SSHSL-LHESDHSYLAW SGT-AS-VVS-E--L--NNFY-PR SGT-AS-VVC-L--L--NNFY-PR SSSAS-ASSVVC-L--L--NNFY-PR L-D-L-ASER-GKE-PDRF SVLL--EAFSSPSD-LEK SL-SKNY-TLNN--DL-TLL NAS-AS-AVC-L--L--NNFY-PR YHTSQSGDEMTSLSE-YVSR A--VFVDL--EPSL-VEQVR VETE-DVGTYYTNMGR SSSEKLLKQKLAKVF ESVTRPPEQASL--PLLSN FS-VCV-L--G--ENQH-CDE---AK SQT-VG-TVC-N--H--NDGE-F SLSVT-PGEGTSL--CSK VETE-DVGTYYAEMER GAS-AS-VVM-L--L--NNFY-PR SN-DLTYLTLNN--DL-TLL TLKLSRLESE-DVGTY SLSVT-PGESASL--CSK NSK-YSDL-TLNN--DLKTLL NSK-YSNL-TLNN--DL-TLL TYQV--P-Y-QVPYQ-VS-D-L-NS ESPW-TFGQSG--K--LD-L-K TVTVS-PGESASL--SCK S----GSGSDKDFTLKLSR TTLEE--LL-PL----KNYEK SLSS--TL-TLSK--GEYEK VGEMSLSVT-PGESASL--SCK QA--S-S-GSPAGLRLL-V-Q-AT VSLSSVTVGNEQK-SNTY SLSVT-PGESASL--SCK DTPW-TFGQGT--K--VD-K-LR LDTE-DVGTYYAEMER LDTE-DVGTYCYCVGR LDTE-DVGTYYCMQGR LDTE-DLGTYYCPMGR VETE-DVGTYYCMQGR KTLLSRVETE-DVGTY SQT-VS-AVC-L--P--DDEH-F DSTY-SLSS--TL-TLSK--A A-C-E-V--THQGLSSP-VT-K VVVA-G-E-F--D-QGSSSE-K VETE-DVGTYYMCGAGR VETE-DVGTYYSMQGR APER---ALVNSMVQQT-L TG-ELLS--AV-HLE---AY VTA-LVNGNVQHVVDA-N LL-D-G--EEAV-AETHPW LQQA-SL-P-L-LSER-YSPL HFSCSL-LNEDGLNENW SLSLS-PADSASL--SC L--L--NNFY-PTR---NLVQW G-ATQQL-L--D-E-A-ER NGEEAVL--VPGSWPSM KNSYNSL--TLNTSHTL-LK LRE---LLVDWVKDWV-AN TFGQGTGGK--VD-L-GKVG TTAP--SAVML--PSAS-D TFGQGT--K--VD-V-GKLN ADFDQ----GSSSEKLQKL TFGQGTG-K--VD-L-KNVG ASS-AS-VVC-L--L--NNFY-PR VGVDSE-DLPLNLSR TG-ELLS--GL-HLE---AY GVVDSEDLPLNLSR SLSVT-PGETASLHSEC ST-CSTS-T-PGVSFR SSQSL-LHGDQSGMK DSTY-SLSG--ML-TLSK VLSG-QSQVE-L-VE-V-ATEK L-Q-Q-ASLP-LGQTPDR SQWVV-CGHSHSL--PR SSHSL-LGGHLLSYE ASS-AS-VVT-D--E--LMVY-PR LT--AV--VN-W-VESLAA--AAN LLSW-YD-NEFGSNYR LQQASL--PLLSNHSS-LKN DSTY-SLSS--TL-TLSK TLSK--GYEEKHKVY L--NFNY-PTR---NLVQW TLSK--KADYQHKVY QT-QL-LL-D-L-ASER TFGQGTGGK--VD-L-KRN SSHSL-LHGDNNRY SSP-VT-KSSRLSCC SSP-VT-KSFGRNEC GLSG-------FYRN SSP-VTGKSFGRNEC QSPQL-LL-D-L-ATDR AL--VNFC-LNEDNVALVNW SQT-VS-AVC-L--Y--NSD GNPTVEVDL-FTSK TLSK--ADYEKHKVY SQT-VS-AVC-L--HGMDNW LQQASL-PLLSNT-GG FS----GSGSTEQTFLK QL--FHP---EQLL-TGK AGGLETL-AN-ESMMR SSSY-SLGA--FL-TLSK SQT-VS-AVC-L--N--YDS TFGQGT--EL-VD-L-KRN FS----GSGSDKDFTLK SSP-VT-KSGLRMEC QT-QL-LL-D-L-ATDR LRAE---ALVNGMVQQT-L ASL-PLLSARE--TCKY SVT-PGESASL--SCK L-AVMR-LE--PDRF GDPSGSPAVDRVLVLG S----GSGSDKDF-LYL SKTLEG----YEKHKVY TLSK--AYEDKHKVY LSGSLLNELLGLVR SQT-VS-AVC-L--PHEDDF TFGQGT--K--VD-N-KRL TFGQGT--EL-VD-K-LRN VTALVDWVWDVA-AAN ASGVPDRFS----SNRS KLDMA-LCAGASGV SSQSL-LHGDNRNY SNL-TLND--NL-TLLK FS----GSGSNKDFTLK TFGQGTG-K--VD-L-KRN TFGQGTG-K--VD-L-KRG VFQQGD--QELVD-L-NRFD TLSK--SEMDKHKVY TLSK--AEDYKHKVY SSSY-SLSS--TL-TLSK TFGQSAN-K--VD-L-KRN TFGQGT--KN-VD-L-KVG YNSLY-SLTLNNDL-TLLK SSHSL-LHGDRPMY LKDMA-LACGASGVSL VTALVNWVVTQA-AAAN SPQL-LL-Y-L-SASR SPQL-LL-D-L-PGDR NSL--TLNTSHTL-LK DNYLAAM-YVQK--P-G-R NDYLAW-YVQK--G-P-R TFGQGTG-K--VD-LGKR ALVNWVVYNW-AN AS-LPL-L--S--NGGFA-N NTL-TLNN--TL-TLLK LSPQL-LY---L-ASSR DNYLAAM-YVGAK--P-G-R SPQL-LL-Y-L-SSAR GSDKDLQPVLSGL NNYLNF-YVQK--P-G-R SPQL-LL-Y-L-SGTR HSSSL-LHGDDRLY NNYLAAM-VYQK--P-G-R KLAE---ALVNNMVQQT-L THVT-LFGDELCK TFGQGT--K--VD-L-KR TFGQGT--K--VDNL-KR DAMLK-LCQ-AS-GV NSL--TLNSTHTL-LK TL-SLNN--DL-TLLK TFGQTG--K--VD-L-KR AGSHSL-LHPSHSYY NNYLAW-YVQK--G-P-R NNYLASEYVQK--P-G-R YNSL--TLNTSHTL-LK DFTLKSLRLDTE TFGQGT--KN-VD-L-KR S----GSGSDKDFTLK TFGQGT--K--VDGL-KR TFGQGTG-K--VD-K-LR KDAMLL-CGA-AS-GV GE-AF-VVG-V----VAGEF NNYLAW-YNLK--P-G-R TFGQGT--KG-VD-R-KL NNYLAW-YVQK--P-G-R SPQL-LL-D-L-ASER SFQL-LL-D-L-ASER LLSSKY-TLNN--DL-TLL NNFY-SSR---LHVQW TFGQGTG-K--VD-L-KR SPQL-LL-D-S-ALER SPQL-LL-D-L-SAER SPQL-LL-Y-L-GSTR D-VG-VLL-L--T--NNAY SPQL-LL-N-D-VVDK LK-D-M-ALCAGASGV SPQL-LL-Y-L-RTGS SPQL-LL-Y-L-GTSR DQGSSSEKQ--LKL NNYLFN-YVQK--P-G-R SVT-PGESASQ--RF SPQL-LL-D-K-QDGK DQGESSP-AT-SRLN L-LL-D-L-LSES-PLK SPQL-LL-D-M-SPLK GTL-ELLS--DV-QLLK A--FSVFL--FNTE-NK S----GSGSDKDTFLK SPGP-HVVD-L-ASER NNYLAW-YVQTMMP-G-R NNYLAW-YVQK--P-R-G GGSGT--P--VD-D--RDL TFGQGT--K--VD-K-LR DNYLAW-YVQK--G-P-R QSANTPGRPTT-Q DNYLSAM-YVQK--P-G-R DNYLAW-YVQK--P-G-R V--ATVGLTVP-VT-R GNYLAGFYVQK--P-G-R ASL--NWDSYPSL-L SPQL-LL-D-G-ENKK NNYLASMYVQK--P-G-R SPQL-LL-Y-L-ASSR NNYLYL-YVQK--G-P-R SPQL-LL-D-L-GTER NNYLCL-YVQK--P-G-R SLDL-SL-D-L-AEVK NNYLAD-YVQK--P-G-R DFVLQT-SP-HSL SKTLAQDYKHKVY ESPSMTFGQSA--K QSTGF-TFGQGT--K VQSR-P-G-LEPQL-L ESPW-TFGQTG--K GYPVTH-QDEK-PGVY LSNTDKDDTNSA ESPAM-TFGQGT--K ALVNAQVHQT-L TFGQGTG-K--VD-L-K YVQK--P-PVQKPSN ESPSMTFGQGT--K VYA-C-E-V--THQAV LYAW-YVQK--P-G-R TFGQGT--K--VD-L-K ESPW-TFGQGT--K DFVVDQ-SP-HSL YNSL--TLDSYNTL-L LSSPASL-HAFLR FGQGT--K--VD-L-KR VQK--P-G-EKPNL-L ALVNW-VDYT-L DFVLQT-SP-HVT QPA-TGT-GT-RAM P-A-LEPVL-LS-G-L SL--TLDHEPTL-L ALVNGQHENV-L SNL-TLNN--NL-TL VTALVQGMVQQT-L LPQS-LL-Y-L-ASSR PQLSLL-Y-L-ASSR SL-LHGVMMMHR LDQ-PM-TELSVR QSPW-TFGQGT--K FL---PPS-DEQLK LPQS-LL-D-L-ASER DLVLTQ-SP-LSL TFGQGS--L--KD-L-K DQGSSTL-QDQK-L NSQ-VRP----LVQW ALVMANVEQT-L DPQL-LL-D-L-ASER GAPQL-LL-D-L-ASER KMGDSL-PMGDA ALV-WDVQET-L SER-FP-VPDRF FVLTQ-SPGHSL DFVLTQ-SP-HSL PAL-EEEAV-PSGWPW NNMY-QS-----LVQ GPTSL-QD-KTGF NPQL-LL-D-L-ASER DFVLTQ-SPGHSL ALVNW-VYDT-L CEPA-LQKGFSGL ALVNNHTDNV-L EP-ATGTGDRGF ESPAM-TFGQTG--K TL-SLNN--DL-TLL LGPHA-VV-D-L-ASER DLP-G-QGSSL-LS-T-L D-L-AANVA-AVGAK DS--LL-AEVK--AQYE DFVLQT-SP-HSL ESPW-TFGQSA--K TLE-VELE-PVGR ESVGM-TFGQGT--K FHQL-DL-DDL-QSLR YCMQGSREPW QL-LL-Y-L-SASR SSQSL-LHGDR QPGLGQGT--K--VD-L-KR AYQL-LL-D-L-ASER GL-GL-D-D-ALEP-R DFVLTQ-SP-HG VETE-DTHGYM T-AS-DVV-V--L--EF LAW-YVQK--P-G-R VCPA-LQPVLS SL-LHGDNNRY SLSS--TL-VQKW EP-ATGTNRDF SL-LHYHAGQY QK-LL-K-L-AKVF EP-AT-GSF-RN WLTLNE--NL-TLLK ELTLSL--TL-TLLK SGT-AS-VVC-L--L SL-LHGAQHYY QL-LL-D-L-GTER ALVQDWVQTL L-LT-D-N-AYCGL-A SLP-MT-VDFLR GQGT--K--VD-K-LR PAL-QL-G-L-ASF L-TLDN--AYMEK GST-AS-VVC-L--L QGFGT--K--VD-L-KR QL-LL-D-L-SAER SGT-AS-VPA-L--L YCMQDRASPW QL-LL-D-L-ASER EVSL-EDSK-AF DFVLTQ-SP-GH A-LQSPKQQQQ L--FPPS-DEQLK SL-LHGPHTYY FS----GSGSDKDF NNFY-PRE---AK QLQN-LL-Q-T-ASR FVLTQ-SP-H MEA-E-E-V--THQGL DFVLTQ-SP-H GVPQLEVTF DWVLTQ-SP-H ADYEKHKVY -VLTQ-SP-H A-C-E-V--THQVA SGT-AS-VVC-L FVLTQ-SP-H VNW-VENH-L LSLSE--TY-DLK KL-SAT-AS-FL S--NL-TDCK--KY DVGVL-L--L--NNTA DNYLAAM-YVQK A-C-E-V--GHTQL KL-SAT-AS-FK DFVLTQ-SP-H LSAA-GT-ASF LLS--TL--LYK L-LL-D-L-SAER NNYLAAM-YVQK NNYLNF-YVQK A-C-E-V--THQGL A-C-E-V--THGQL SET-VS-AVK-L G-QTPQR-QL-W ALVNW-VEQ AE-GVL-L--L--NN GSTA-SLGS--TA GP-G-QSSLD-LL L-LL-D-L-ARTD A-C-E-V--THANL ALVDW-VEQ DLVLTQ-SP-L RASLA--PSVF NNYLAW-YVQK SET-VG-TVK-L L-LC-G-L-LAER TS----PSGHVVDF L-LL-D-L-ASER DFVTQL-SP-H L-LA-D-Q-AEAR S--NL-TNCK--KY A-C-E-V--THQAV NNYLASMYVQK AW-YVQK--G-P-R VV--WHCGVTT SPQL-LL-Y-L LKLTGT-AS-F DVGVL-L--L--NNT FEDENFLLK LST--AAYAK CMQGSREPW SLAA--PSVF PLTQ-SL-PLL L-LL-D-L-SMK LL-L-L-AEGR GY--D--VD-L-MR KL-TGT-AS-F ELL-D-L-VLDR LK-AST-AS-F SSP-VT-KSF LK-SAT-AS-F YPQL-LP-G-L-R KTSLAA--SF CMQGERSPW AE-GVL-L--L--N LCGA-SL-LSL DNDLTLML DWVLLQ-TL SLGLHQDGW LK-STA-AS-F TLL-D-L-DSRQ KLL-SAT-AS-F LK-TGTLAS-F ASGVFPRD TLVT--PEVF SGLAA--PSVF ASGVPDRF TLL-D-L-DSQR GTGVPDRF LL-E-L-TGPK KL-SAT-AS-F SFTVAA--PSVF SL-LHGDR QSGVPDRF DVVGL-L--L--NN NS--WL-TLLK DVGVL-L--L--NN L-Y-L-SSAR LPQS-LL-D-L E--TL-TLLK GLV---TLVQW NCQGRESPW VQQKYSN L--DNFY-PR DFTLKLS VT-WGKSF TLSK--ADY VCK--P--ANA VQEKSYN VQEKYSN L--NNFY-PR LAL--AKVF LNN--NL-TL NLPF--PEVF TP-VA-KVF LKLAKVF VQQKSYN YELAKVF TLVK--SYW NNFY-PR KDFTLK AHVEHA-LQ KDTFLK GLSFGRN TTLLTQ-SP-H KFDTLK VS-VRV-L--L YCMQGR VVSAA----GSGSD KE---ALVDW YTGVPDR LSPQL-LY NDFY-PR LLES--TL-K VTALVPW DCL-LL-D-R YVLLLSR MTALVNW LTALVNW FYE-QFSK VTALVNW KYGEGT--K

C109_002

Type	Read
Score	40
Start on Template	9
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_062

Type	Read
Score	53
Start on Template	158
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	19
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C90

Type	Read
Score	46
Start on Template	200
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C128_002

Type	Read
Score	34
Start on Template	49
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1010

Type	Read
Score	46
Start on Template	47
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	21
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3509

Type	Read
Score	91
Start on Template	80
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C105_002

Type	Read
Score	65
Start on Template	82
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C116_003

Type	Read
Score	101
Start on Template	98
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1138

Type	Read
Score	62
Start on Template	97
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C102_003

Type	Read
Score	80
Start on Template	81
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_050

Type	Read
Score	74
Start on Template	97
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_054

Type	Read
Score	78
Start on Template	47
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_076

Type	Read
Score	96
Start on Template	97
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_071

Type	Read
Score	136
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C160_003

Type	Read
Score	116
Start on Template	9
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	19
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_072

Type	Read
Score	95
Start on Template	81
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_077

Type	Read
Score	114
Start on Template	97
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C193_002

Type	Read
Score	104
Start on Template	81
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_080

Type	Read
Score	79
Start on Template	97
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1274

Type	Read
Score	92
Start on Template	82
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C173_002

Type	Read
Score	126
Start on Template	79
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C185

Type	Read
Score	111
Start on Template	82
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C216_002

Type	Read
Score	170
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C217

Type	Read
Score	148
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C256_003

Type	Read
Score	147
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_098

Type	Read
Score	29
Start on Template	150
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_322

Type	Read
Score	29
Start on Template	77
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1588

Type	Read
Score	38
Start on Template	129
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_189

Type	Read
Score	29
Start on Template	114
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_324

Type	Read
Score	34
Start on Template	166
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_264

Type	Read
Score	42
Start on Template	115
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_891

Type	Read
Score	42
Start on Template	164
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_356

Type	Read
Score	29
Start on Template	150
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_320

Type	Read
Score	34
Start on Template	129
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_225

Type	Read
Score	36
Start on Template	129
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_362

Type	Read
Score	44
Start on Template	113
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2251

Type	Read
Score	45
Start on Template	131
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3248

Type	Read
Score	29
Start on Template	148
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1700_002

Type	Read
Score	32
Start on Template	148
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_392

Type	Read
Score	33
Start on Template	129
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_367

Type	Read
Score	29
Start on Template	148
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1938_002

Type	Read
Score	40
Start on Template	54
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C62

Type	Read
Score	29
Start on Template	150
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_478

Type	Read
Score	30
Start on Template	200
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_400

Type	Read
Score	47
Start on Template	175
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C268_002

Type	Read
Score	36
Start on Template	131
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_390

Type	Read
Score	38
Start on Template	129
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_666

Type	Read
Score	55
Start on Template	70
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_693

Type	Read
Score	44
Start on Template	180
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_415

Type	Read
Score	72
Start on Template	197
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C195_002

Type	Read
Score	94
Start on Template	9
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C201_003

Type	Read
Score	162
Start on Template	153
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	26
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_386

Type	Read
Score	36
Start on Template	93
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1806

Type	Read
Score	43
Start on Template	64
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_388

Type	Read
Score	72
Start on Template	0
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_389

Type	Read
Score	44
Start on Template	91
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_395

Type	Read
Score	88
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_422

Type	Read
Score	40
Start on Template	94
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C87_003

Type	Read
Score	45
Start on Template	197
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C191_002

Type	Read
Score	43
Start on Template	54
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C290_004

Type	Read
Score	100
Start on Template	9
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	21
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C744_003

Type	Read
Score	35
Start on Template	154
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_497

Type	Read
Score	37
Start on Template	155
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C49_002

Type	Read
Score	59
Start on Template	184
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C505_002

Type	Read
Score	45
Start on Template	62
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	20
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1720

Type	Read
Score	95
Start on Template	184
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C154_005

Type	Read
Score	121
Start on Template	9
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C164_004

Type	Read
Score	182
Start on Template	153
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	25
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C217_004

Type	Read
Score	36
Start on Template	93
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C615

Type	Read
Score	65
Start on Template	140
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C56_002

Type	Read
Score	59
Start on Template	184
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1850

Type	Read
Score	104
Start on Template	206
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_503

Type	Read
Score	64
Start on Template	206
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C114_002

Type	Read
Score	42
Start on Template	68
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C163_003

Type	Read
Score	93
Start on Template	9
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C170_004

Type	Read
Score	145
Start on Template	155
Length on Template	23
Start on Read	0
Length of Read	25
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C268_004

Type	Read
Score	43
Start on Template	69
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_510

Type	Read
Score	50
Start on Template	131
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1522_002

Type	Read
Score	29
Start on Template	184
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C199_005

Type	Read
Score	117
Start on Template	9
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1137_003

Type	Read
Score	43
Start on Template	131
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_541

Type	Read
Score	36
Start on Template	136
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C163_005

Type	Read
Score	41
Start on Template	203
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C528_003

Type	Read
Score	49
Start on Template	188
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	23
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C968_006

Type	Read
Score	47
Start on Template	25
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_606

Type	Read
Score	29
Start on Template	148
Length on Template	5
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1283

Type	Read
Score	52
Start on Template	47
Length on Template	28
Start on Read	0
Length of Read	25
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1630

Type	Read
Score	40
Start on Template	19
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1837_004

Type	Read
Score	41
Start on Template	51
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_635

Type	Read
Score	39
Start on Template	103
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C557_003

Type	Read
Score	36
Start on Template	131
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1012_003

Type	Read
Score	53
Start on Template	155
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	23
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1288

Type	Read
Score	51
Start on Template	18
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1430_005

Type	Read
Score	51
Start on Template	134
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C265_004

Type	Read
Score	37
Start on Template	159
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C2079_002

Type	Read
Score	53
Start on Template	47
Length on Template	27
Start on Read	0
Length of Read	26
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C353_005

Type	Read
Score	37
Start on Template	129
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2247

Type	Read
Score	67
Start on Template	172
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C175_008

Type	Read
Score	44
Start on Template	167
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1166

Type	Read
Score	39
Start on Template	155
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2584

Type	Read
Score	53
Start on Template	11
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1436_004

Type	Read
Score	44
Start on Template	140
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_984

Type	Read
Score	67
Start on Template	172
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1617_003

Type	Read
Score	41
Start on Template	131
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_941

Type	Read
Score	47
Start on Template	176
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C2865_002

Type	Read
Score	46
Start on Template	18
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C2868

Type	Read
Score	43
Start on Template	106
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3446

Type	Read
Score	59
Start on Template	25
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_963

Type	Read
Score	104
Start on Template	11
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_893

Type	Read
Score	96
Start on Template	101
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_894

Type	Read
Score	96
Start on Template	67
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_895

Type	Read
Score	120
Start on Template	197
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_967

Type	Read
Score	88
Start on Template	101
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1023

Type	Read
Score	64
Start on Template	59
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3805

Type	Read
Score	95
Start on Template	66
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_899

Type	Read
Score	108
Start on Template	9
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_853

Type	Read
Score	68
Start on Template	120
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1269

Type	Read
Score	97
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C657_005

Type	Read
Score	99
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1236_002

Type	Read
Score	147
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1484_002

Type	Read
Score	63
Start on Template	172
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1546_003

Type	Read
Score	45
Start on Template	131
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_933

Type	Read
Score	80
Start on Template	131
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1930_005

Type	Read
Score	46
Start on Template	162
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C2346

Type	Read
Score	43
Start on Template	57
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1005

Type	Read
Score	128
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C3052

Type	Read
Score	43
Start on Template	148
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C134_005

Type	Read
Score	77
Start on Template	24
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_962

Type	Read
Score	62
Start on Template	197
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C234_006

Type	Read
Score	44
Start on Template	27
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3695

Type	Read
Score	190
Start on Template	153
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	25
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_970

Type	Read
Score	104
Start on Template	66
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C598_005

Type	Read
Score	97
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C647_004

Type	Read
Score	92
Start on Template	9
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C656_004

Type	Read
Score	39
Start on Template	51
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1016_004

Type	Read
Score	50
Start on Template	59
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	23
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1233_002

Type	Read
Score	142
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1571_002

Type	Read
Score	37
Start on Template	181
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1823_002

Type	Read
Score	29
Start on Template	150
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1014

Type	Read
Score	63
Start on Template	188
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1015

Type	Read
Score	39
Start on Template	91
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	6
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C176_004

Type	Read
Score	77
Start on Template	24
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C232_008

Type	Read
Score	68
Start on Template	184
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C283_006

Type	Read
Score	115
Start on Template	158
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	20
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3396

Type	Read
Score	78
Start on Template	101
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3471

Type	Read
Score	88
Start on Template	102
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C306_004

Type	Read
Score	62
Start on Template	103
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3804

Type	Read
Score	84
Start on Template	67
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C389_002

Type	Read
Score	69
Start on Template	11
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C463_005

Type	Read
Score	112
Start on Template	193
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	21
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1025

Type	Read
Score	120
Start on Template	9
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C627_002

Type	Read
Score	106
Start on Template	155
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	23
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C685_004

Type	Read
Score	118
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1027

Type	Read
Score	107
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1028

Type	Read
Score	62
Start on Template	37
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1030

Type	Read
Score	69
Start on Template	97
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1033

Type	Read
Score	102
Start on Template	178
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C865

Type	Read
Score	95
Start on Template	9
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	22
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C869_005

Type	Read
Score	63
Start on Template	0
Length on Template	9
Start on Read	2
Length of Read	8
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C932_003

Type	Read
Score	104
Start on Template	97
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C933_003

Type	Read
Score	35
Start on Template	82
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1035_002

Type	Read
Score	83
Start on Template	24
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1139

Type	Read
Score	50
Start on Template	59
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1040

Type	Read
Score	64
Start on Template	113
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1309_003

Type	Read
Score	54
Start on Template	47
Length on Template	30
Start on Read	0
Length of Read	26
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1324_003

Type	Read
Score	161
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1336_004

Type	Read
Score	165
Start on Template	2
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	24
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1041

Type	Read
Score	44
Start on Template	178
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1421_002

Type	Read
Score	144
Start on Template	0
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	24
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1042

Type	Read
Score	146
Start on Template	0
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	25
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_995

Type	Read
Score	144
Start on Template	113
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1144

Type	Read
Score	134
Start on Template	113
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C2691_002

Type	Read
Score	104
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	19
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C2709_002

Type	Read
Score	110
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C168_006

Type	Read
Score	58
Start on Template	24
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1719

Type	Read
Score	47
Start on Template	184
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C215_003

Type	Read
Score	77
Start on Template	184
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C271_003

Type	Read
Score	159
Start on Template	153
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	21
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C352_003

Type	Read
Score	48
Start on Template	141
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	6
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C368_005

Type	Read
Score	33
Start on Template	179
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C415_002

Type	Read
Score	68
Start on Template	11
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C421_004

Type	Read
Score	43
Start on Template	141
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	6
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C479_005

Type	Read
Score	152
Start on Template	153
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	26
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C730_004

Type	Read
Score	152
Start on Template	5
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	19
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C774_003

Type	Read
Score	45
Start on Template	112
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1032_002

Type	Read
Score	192
Start on Template	150
Length on Template	28
Start on Read	0
Length of Read	28
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3525

Type	Read
Score	36
Start on Template	25
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1328_003

Type	Read
Score	192
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1342_004

Type	Read
Score	145
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	23
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C2199_002

Type	Read
Score	109
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1546

Type	Read
Score	108
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C2736

Type	Read
Score	65
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C2754_002

Type	Read
Score	110
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C202_004

Type	Read
Score	65
Start on Template	82
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1091

Type	Read
Score	96
Start on Template	47
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1008

Type	Read
Score	105
Start on Template	113
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C263_007

Type	Read
Score	39
Start on Template	205
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C240_004

Type	Read
Score	65
Start on Template	82
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1122

Type	Read
Score	77
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C239_006

Type	Read
Score	67
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1113

Type	Read
Score	112
Start on Template	174
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C574_002

Type	Read
Score	48
Start on Template	158
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	20
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C675_004

Type	Read
Score	107
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C702_004

Type	Read
Score	150
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1130

Type	Read
Score	118
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1154

Type	Read
Score	80
Start on Template	49
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1134

Type	Read
Score	87
Start on Template	47
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1145

Type	Read
Score	36
Start on Template	73
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	6
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1147

Type	Read
Score	109
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1137

Type	Read
Score	102
Start on Template	82
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1112

Type	Read
Score	65
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C715_004

Type	Read
Score	54
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C742_004

Type	Read
Score	160
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C754_005

Type	Read
Score	132
Start on Template	113
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1098_004

Type	Read
Score	47
Start on Template	133
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C16_006

Type	Read
Score	62
Start on Template	24
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1258

Type	Read
Score	36
Start on Template	73
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	6
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C162_005

Type	Read
Score	118
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C187_005

Type	Read
Score	66
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C703_004

Type	Read
Score	95
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1408

Type	Read
Score	98
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C98_013

Type	Read
Score	133
Start on Template	155
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	20
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C192_010

Type	Read
Score	118
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C447_005

Type	Read
Score	60
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1225

Type	Read
Score	84
Start on Template	47
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C699_002

Type	Read
Score	39
Start on Template	205
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C782_003

Type	Read
Score	100
Start on Template	132
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C850_004

Type	Read
Score	56
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1146_002

Type	Read
Score	70
Start on Template	49
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1159

Type	Read
Score	105
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1230_003

Type	Read
Score	85
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C118_007

Type	Read
Score	43
Start on Template	97
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C242_009

Type	Read
Score	60
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C268_008

Type	Read
Score	68
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C402_005

Type	Read
Score	70
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1169

Type	Read
Score	72
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C820_005

Type	Read
Score	116
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1231

Type	Read
Score	123
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C854_004

Type	Read
Score	78
Start on Template	47
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C862_002

Type	Read
Score	155
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1042

Type	Read
Score	104
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1172

Type	Read
Score	68
Start on Template	49
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1277_005

Type	Read
Score	65
Start on Template	46
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1183

Type	Read
Score	86
Start on Template	48
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C80_005

Type	Read
Score	97
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C132_008

Type	Read
Score	57
Start on Template	97
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1164

Type	Read
Score	56
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C820_006

Type	Read
Score	121
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C865_003

Type	Read
Score	51
Start on Template	47
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C889_005

Type	Read
Score	130
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C907_005

Type	Read
Score	56
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1023_005

Type	Read
Score	107
Start on Template	113
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1287_004

Type	Read
Score	79
Start on Template	46
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1244

Type	Read
Score	87
Start on Template	48
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1345_004

Type	Read
Score	90
Start on Template	46
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C79_006

Type	Read
Score	47
Start on Template	27
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C187_006

Type	Read
Score	40
Start on Template	50
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1189

Type	Read
Score	151
Start on Template	154
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	20
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C309_008

Type	Read
Score	29
Start on Template	50
Length on Template	5
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1256

Type	Read
Score	29
Start on Template	169
Length on Template	5
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C488_005

Type	Read
Score	78
Start on Template	195
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C505_008

Type	Read
Score	106
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1197

Type	Read
Score	80
Start on Template	121
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1277

Type	Read
Score	53
Start on Template	97
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C623_006

Type	Read
Score	97
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C642_003

Type	Read
Score	106
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C679_002

Type	Read
Score	90
Start on Template	79
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1453

Type	Read
Score	43
Start on Template	50
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1444

Type	Read
Score	53
Start on Template	183
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C769_005

Type	Read
Score	41
Start on Template	51
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C770_003

Type	Read
Score	42
Start on Template	3
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C798_006

Type	Read
Score	34
Start on Template	27
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C839_005

Type	Read
Score	50
Start on Template	165
Length on Template	23
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C852_005

Type	Read
Score	58
Start on Template	36
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C860_006

Type	Read
Score	91
Start on Template	82
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C922_004

Type	Read
Score	43
Start on Template	178
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C948_004

Type	Read
Score	51
Start on Template	169
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1079_002

Type	Read
Score	56
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1095_006

Type	Read
Score	42
Start on Template	39
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1097_004

Type	Read
Score	34
Start on Template	50
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1230_004

Type	Read
Score	31
Start on Template	71
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1309

Type	Read
Score	72
Start on Template	50
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1491

Type	Read
Score	36
Start on Template	50
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1318

Type	Read
Score	77
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1487

Type	Read
Score	72
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1316

Type	Read
Score	46
Start on Template	68
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1316_004

Type	Read
Score	65
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1227

Type	Read
Score	62
Start on Template	35
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1420_004

Type	Read
Score	39
Start on Template	49
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1457_005

Type	Read
Score	37
Start on Template	176
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1505_005

Type	Read
Score	43
Start on Template	17
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1506_003

Type	Read
Score	79
Start on Template	97
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1527

Type	Read
Score	46
Start on Template	197
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	20
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1627_005

Type	Read
Score	46
Start on Template	126
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	21
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1219

Type	Read
Score	121
Start on Template	5
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	19
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1357

Type	Read
Score	54
Start on Template	0
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1516

Type	Read
Score	91
Start on Template	5
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1718_005

Type	Read
Score	55
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1733_003

Type	Read
Score	50
Start on Template	20
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1367

Type	Read
Score	106
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1760_004

Type	Read
Score	35
Start on Template	206
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1533

Type	Read
Score	48
Start on Template	47
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1387

Type	Read
Score	36
Start on Template	51
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1541

Type	Read
Score	174
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C2204_002

Type	Read
Score	39
Start on Template	116
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1552

Type	Read
Score	46
Start on Template	116
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1558

Type	Read
Score	40
Start on Template	176
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C2266

Type	Read
Score	51
Start on Template	47
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C2273_003

Type	Read
Score	51
Start on Template	50
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1411

Type	Read
Score	94
Start on Template	175
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C2365_002

Type	Read
Score	122
Start on Template	113
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	20
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C2508_002

Type	Read
Score	51
Start on Template	47
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C2541_002

Type	Read
Score	95
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1565

Type	Read
Score	46
Start on Template	176
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C2627_003

Type	Read
Score	49
Start on Template	0
Length on Template	20
Start on Read	8
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C2631_002

Type	Read
Score	88
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1245

Type	Read
Score	46
Start on Template	115
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1424

Type	Read
Score	40
Start on Template	69
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C2796_004

Type	Read
Score	78
Start on Template	49
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C56_005

Type	Read
Score	48
Start on Template	73
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	6
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1433

Type	Read
Score	160
Start on Template	154
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	20
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1449

Type	Read
Score	109
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C176_006

Type	Read
Score	98
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C341_006

Type	Read
Score	43
Start on Template	50
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C489_005

Type	Read
Score	88
Start on Template	82
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C497_005

Type	Read
Score	35
Start on Template	79
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C507_005

Type	Read
Score	75
Start on Template	82
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C508_010

Type	Read
Score	71
Start on Template	82
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C610_006

Type	Read
Score	51
Start on Template	159
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	19
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C615_006

Type	Read
Score	46
Start on Template	61
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C674_005

Type	Read
Score	64
Start on Template	97
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1476

Type	Read
Score	38
Start on Template	61
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C681_002

Type	Read
Score	109
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C833_003

Type	Read
Score	272
Start on Template	154
Length on Template	34
Start on Read	0
Length of Read	34
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C839_006

Type	Read
Score	41
Start on Template	35
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C896_007

Type	Read
Score	41
Start on Template	68
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C902_004

Type	Read
Score	42
Start on Template	47
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1496

Type	Read
Score	40
Start on Template	161
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C988_005

Type	Read
Score	36
Start on Template	48
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1499

Type	Read
Score	46
Start on Template	176
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1513

Type	Read
Score	55
Start on Template	154
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	20
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1198_003

Type	Read
Score	119
Start on Template	5
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	19
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1229_002

Type	Read
Score	96
Start on Template	5
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1517

Type	Read
Score	57
Start on Template	35
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1354_006

Type	Read
Score	60
Start on Template	86
Length on Template	22
Start on Read	0
Length of Read	22
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1424_003

Type	Read
Score	50
Start on Template	48
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1538

Type	Read
Score	87
Start on Template	48
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1583_004

Type	Read
Score	54
Start on Template	3
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	22
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1594

Type	Read
Score	152
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1611_005

Type	Read
Score	133
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1543

Type	Read
Score	107
Start on Template	113
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1963_008

Type	Read
Score	46
Start on Template	48
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1572

Type	Read
Score	132
Start on Template	113
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C2044_006

Type	Read
Score	96
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C2052_005

Type	Read
Score	101
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C2100_003

Type	Read
Score	50
Start on Template	131
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1428

Type	Read
Score	119
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1584

Type	Read
Score	100
Start on Template	132
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C49_007

Type	Read
Score	42
Start on Template	60
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C119_010

Type	Read
Score	135
Start on Template	154
Length on Template	20
Start on Read	0
Length of Read	19
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2877

Type	Read
Score	124
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C188_005

Type	Read
Score	98
Start on Template	9
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C240_007

Type	Read
Score	118
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C261_016

Type	Read
Score	51
Start on Template	97
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C279_010

Type	Read
Score	74
Start on Template	82
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C319_007

Type	Read
Score	68
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C332_002

Type	Read
Score	40
Start on Template	45
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C338_005

Type	Read
Score	44
Start on Template	135
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C347_010

Type	Read
Score	96
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C359_010

Type	Read
Score	60
Start on Template	97
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C420_004

Type	Read
Score	37
Start on Template	105
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C506_006

Type	Read
Score	56
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C595_005

Type	Read
Score	38
Start on Template	203
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C598_007

Type	Read
Score	34
Start on Template	179
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C603_005

Type	Read
Score	68
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C617_003

Type	Read
Score	37
Start on Template	50
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1534

Type	Read
Score	42
Start on Template	121
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C842_003

Type	Read
Score	29
Start on Template	77
Length on Template	5
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C880_004

Type	Read
Score	60
Start on Template	50
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C921_003

Type	Read
Score	57
Start on Template	35
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C969_004

Type	Read
Score	86
Start on Template	47
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C990_006

Type	Read
Score	53
Start on Template	35
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1013_005

Type	Read
Score	77
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1518

Type	Read
Score	143
Start on Template	5
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	19
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1477_005

Type	Read
Score	56
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1553_006

Type	Read
Score	69
Start on Template	47
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1629_007

Type	Read
Score	94
Start on Template	174
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1707_004

Type	Read
Score	54
Start on Template	3
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	22
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1835_008

Type	Read
Score	116
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	24
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1868_005

Type	Read
Score	52
Start on Template	47
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1869_006

Type	Read
Score	50
Start on Template	134
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1571

Type	Read
Score	114
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C2021_004

Type	Read
Score	123
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C2080_003

Type	Read
Score	70
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C2097_005

Type	Read
Score	67
Start on Template	175
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C2163_004

Type	Read
Score	101
Start on Template	133
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C295_010

Type	Read
Score	45
Start on Template	131
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1659

Type	Read
Score	45
Start on Template	146
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1623

Type	Read
Score	37
Start on Template	69
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1751

Type	Read
Score	33
Start on Template	207
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1685

Type	Read
Score	43
Start on Template	15
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1689

Type	Read
Score	34
Start on Template	148
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2529

Type	Read
Score	37
Start on Template	111
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1865_007

Type	Read
Score	50
Start on Template	145
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1651

Type	Read
Score	29
Start on Template	190
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C100_007

Type	Read
Score	86
Start on Template	184
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3001

Type	Read
Score	35
Start on Template	148
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1062_006

Type	Read
Score	47
Start on Template	172
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1887_006

Type	Read
Score	39
Start on Template	146
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C168_012

Type	Read
Score	60
Start on Template	197
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1835

Type	Read
Score	85
Start on Template	139
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1758

Type	Read
Score	89
Start on Template	50
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1535_004

Type	Read
Score	43
Start on Template	148
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C398_010

Type	Read
Score	43
Start on Template	12
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C443_009

Type	Read
Score	49
Start on Template	195
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	20
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C458_006

Type	Read
Score	73
Start on Template	52
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C2265_003

Type	Read
Score	39
Start on Template	147
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C2322_002

Type	Read
Score	45
Start on Template	145
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C477_005

Type	Read
Score	102
Start on Template	76
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C585_004

Type	Read
Score	51
Start on Template	141
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2481

Type	Read
Score	48
Start on Template	60
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	22
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C857_006

Type	Read
Score	56
Start on Template	11
Length on Template	27
Start on Read	0
Length of Read	26
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1116_006

Type	Read
Score	88
Start on Template	50
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1814

Type	Read
Score	36
Start on Template	148
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C111_016

Type	Read
Score	40
Start on Template	45
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C169_009

Type	Read
Score	77
Start on Template	206
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C711_010

Type	Read
Score	93
Start on Template	76
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C755_007

Type	Read
Score	84
Start on Template	9
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1589_004

Type	Read
Score	75
Start on Template	50
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C133_012

Type	Read
Score	86
Start on Template	184
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C798_009

Type	Read
Score	34
Start on Template	204
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1039_005

Type	Read
Score	72
Start on Template	161
Length on Template	28
Start on Read	0
Length of Read	30
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1321_006

Type	Read
Score	47
Start on Template	131
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1423_005

Type	Read
Score	89
Start on Template	50
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1924_005

Type	Read
Score	38
Start on Template	148
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C80_011

Type	Read
Score	28
Start on Template	41
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C293_008

Type	Read
Score	50
Start on Template	56
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C445_004

Type	Read
Score	44
Start on Template	91
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1224_002

Type	Read
Score	62
Start on Template	13
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	27
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1298_005

Type	Read
Score	89
Start on Template	50
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C104_013

Type	Read
Score	44
Start on Template	175
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C575_003

Type	Read
Score	34
Start on Template	23
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2077

Type	Read
Score	39
Start on Template	50
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C841_009

Type	Read
Score	44
Start on Template	44
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1988

Type	Read
Score	35
Start on Template	136
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_1951

Type	Read
Score	34
Start on Template	136
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C606_009

Type	Read
Score	32
Start on Template	141
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1626_006

Type	Read
Score	41
Start on Template	44
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2052

Type	Read
Score	120
Start on Template	174
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2161

Type	Read
Score	67
Start on Template	74
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1173_002

Type	Read
Score	50
Start on Template	64
Length on Template	28
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1823_005

Type	Read
Score	89
Start on Template	35
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	19
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1088_004

Type	Read
Score	144
Start on Template	171
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1602_005

Type	Read
Score	93
Start on Template	5
Length on Template	27
Start on Read	0
Length of Read	25
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1095_010

Type	Read
Score	56
Start on Template	74
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1630_004

Type	Read
Score	102
Start on Template	5
Length on Template	27
Start on Read	0
Length of Read	26
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C2056_007

Type	Read
Score	91
Start on Template	35
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	19
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3344

Type	Read
Score	54
Start on Template	59
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2651

Type	Read
Score	45
Start on Template	51
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2490

Type	Read
Score	53
Start on Template	127
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1499_003

Type	Read
Score	54
Start on Template	45
Length on Template	29
Start on Read	0
Length of Read	28
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2348

Type	Read
Score	55
Start on Template	176
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2711

Type	Read
Score	53
Start on Template	19
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C351_011

Type	Read
Score	42
Start on Template	126
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2611

Type	Read
Score	29
Start on Template	179
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C909_009

Type	Read
Score	55
Start on Template	163
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	26
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1141_009

Type	Read
Score	52
Start on Template	153
Length on Template	26
Start on Read	0
Length of Read	25
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3653

Type	Read
Score	38
Start on Template	3
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1491_009

Type	Read
Score	59
Start on Template	172
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2429

Type	Read
Score	63
Start on Template	171
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2437

Type	Read
Score	53
Start on Template	172
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2466

Type	Read
Score	38
Start on Template	6
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2468

Type	Read
Score	35
Start on Template	67
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2697

Type	Read
Score	37
Start on Template	129
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C415_012

Type	Read
Score	40
Start on Template	195
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2477

Type	Read
Score	35
Start on Template	3
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1228_005

Type	Read
Score	58
Start on Template	171
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3654

Type	Read
Score	37
Start on Template	72
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2830

Type	Read
Score	29
Start on Template	12
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2745

Type	Read
Score	52
Start on Template	19
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3672

Type	Read
Score	46
Start on Template	172
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C315_009

Type	Read
Score	36
Start on Template	205
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2524

Type	Read
Score	56
Start on Template	140
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1586_007

Type	Read
Score	40
Start on Template	102
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C117_013

Type	Read
Score	33
Start on Template	129
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3681

Type	Read
Score	33
Start on Template	103
Length on Template	5
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3323

Type	Read
Score	37
Start on Template	59
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2696

Type	Read
Score	51
Start on Template	140
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2731

Type	Read
Score	41
Start on Template	126
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C737_007

Type	Read
Score	47
Start on Template	49
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1309_008

Type	Read
Score	41
Start on Template	132
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3717

Type	Read
Score	36
Start on Template	181
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2649

Type	Read
Score	40
Start on Template	52
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1126_009

Type	Read
Score	45
Start on Template	50
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C300_008

Type	Read
Score	181
Start on Template	153
Length on Template	25
Start on Read	0
Length of Read	25
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C520_009

Type	Read
Score	41
Start on Template	153
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2650

Type	Read
Score	42
Start on Template	181
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1421_008

Type	Read
Score	49
Start on Template	17
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1538_013

Type	Read
Score	44
Start on Template	128
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1705_004

Type	Read
Score	49
Start on Template	45
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2713

Type	Read
Score	78
Start on Template	48
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C510_006

Type	Read
Score	96
Start on Template	9
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1977_005

Type	Read
Score	47
Start on Template	172
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2716

Type	Read
Score	39
Start on Template	148
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C167_016

Type	Read
Score	35
Start on Template	157
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C184_015

Type	Read
Score	62
Start on Template	197
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C209_011

Type	Read
Score	58
Start on Template	24
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1443_012

Type	Read
Score	55
Start on Template	178
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1619_009

Type	Read
Score	53
Start on Template	19
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C192_022

Type	Read
Score	77
Start on Template	59
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C922_014

Type	Read
Score	40
Start on Template	134
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1859_009

Type	Read
Score	55
Start on Template	172
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C262_011

Type	Read
Score	77
Start on Template	24
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C541_009

Type	Read
Score	89
Start on Template	9
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1426_005

Type	Read
Score	63
Start on Template	172
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C366_015

Type	Read
Score	46
Start on Template	42
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3706

Type	Read
Score	58
Start on Template	48
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2876

Type	Read
Score	57
Start on Template	47
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3499

Type	Read
Score	69
Start on Template	47
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2884

Type	Read
Score	60
Start on Template	48
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C549_018

Type	Read
Score	60
Start on Template	47
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C134_019

Type	Read
Score	110
Start on Template	196
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3521

Type	Read
Score	66
Start on Template	47
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C54_015

Type	Read
Score	29
Start on Template	150
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C802_010

Type	Read
Score	32
Start on Template	0
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C962_011

Type	Read
Score	38
Start on Template	175
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C332_009

Type	Read
Score	54
Start on Template	0
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_2967

Type	Read
Score	35
Start on Template	67
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1684_010

Type	Read
Score	42
Start on Template	148
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1493_010

Type	Read
Score	38
Start on Template	148
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1532_011

Type	Read
Score	37
Start on Template	19
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1567_011

Type	Read
Score	38
Start on Template	44
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C2099_006

Type	Read
Score	45
Start on Template	136
Length on Template	23
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1

Type	Read
Score	36
Start on Template	181
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C708_014

Type	Read
Score	66
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C423_018

Type	Read
Score	35
Start on Template	49
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1776_007

Type	Read
Score	41
Start on Template	148
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C115_012

Type	Read
Score	62
Start on Template	197
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C178_022

Type	Read
Score	65
Start on Template	41
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3080

Type	Read
Score	42
Start on Template	181
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1526_008

Type	Read
Score	49
Start on Template	134
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C635_010

Type	Read
Score	38
Start on Template	53
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3233

Type	Read
Score	41
Start on Template	134
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C103_029

Type	Read
Score	37
Start on Template	207
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C175_021

Type	Read
Score	36
Start on Template	57
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C60_027

Type	Read
Score	32
Start on Template	154
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C171_021

Type	Read
Score	36
Start on Template	128
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C584_018

Type	Read
Score	31
Start on Template	51
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C2898_002

Type	Read
Score	36
Start on Template	113
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1710_006

Type	Read
Score	35
Start on Template	133
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C2140_010

Type	Read
Score	41
Start on Template	178
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3298

Type	Read
Score	32
Start on Template	114
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C965_012

Type	Read
Score	36
Start on Template	51
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1988_011

Type	Read
Score	54
Start on Template	176
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3342

Type	Read
Score	55
Start on Template	60
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C3477

Type	Read
Score	33
Start on Template	146
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3365

Type	Read
Score	71
Start on Template	0
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1916_016

Type	Read
Score	45
Start on Template	175
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3364

Type	Read
Score	29
Start on Template	52
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3383

Type	Read
Score	63
Start on Template	0
Length on Template	9
Start on Read	2
Length of Read	8
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3385

Type	Read
Score	72
Start on Template	0
Length on Template	9
Start on Read	1
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1727_012

Type	Read
Score	29
Start on Template	148
Length on Template	5
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3389

Type	Read
Score	38
Start on Template	47
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3394

Type	Read
Score	84
Start on Template	101
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C274_023

Type	Read
Score	56
Start on Template	101
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C385_020

Type	Read
Score	61
Start on Template	101
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3841

Type	Read
Score	68
Start on Template	131
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3412

Type	Read
Score	44
Start on Template	48
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C227_016

Type	Read
Score	83
Start on Template	101
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C442_014

Type	Read
Score	53
Start on Template	41
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C2481_004

Type	Read
Score	38
Start on Template	147
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3416

Type	Read
Score	66
Start on Template	101
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C208_025

Type	Read
Score	83
Start on Template	101
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C223_018

Type	Read
Score	73
Start on Template	101
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C236_021

Type	Read
Score	73
Start on Template	101
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C360_015

Type	Read
Score	84
Start on Template	101
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C383_022

Type	Read
Score	76
Start on Template	101
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C535_010

Type	Read
Score	74
Start on Template	101
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C661_015

Type	Read
Score	96
Start on Template	9
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C734_017

Type	Read
Score	67
Start on Template	101
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C856_006

Type	Read
Score	34
Start on Template	27
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3449

Type	Read
Score	86
Start on Template	101
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1000_009

Type	Read
Score	62
Start on Template	0
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1017_014

Type	Read
Score	61
Start on Template	197
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1143_012

Type	Read
Score	102
Start on Template	97
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1220_013

Type	Read
Score	84
Start on Template	101
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1372_013

Type	Read
Score	29
Start on Template	135
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1484_008

Type	Read
Score	54
Start on Template	113
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1602_011

Type	Read
Score	87
Start on Template	41
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	19
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1697_010

Type	Read
Score	67
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	2
Length of Read	11
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1712_011

Type	Read
Score	76
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	1
Length of Read	11
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1969_009

Type	Read
Score	84
Start on Template	101
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3461

Type	Read
Score	29
Start on Template	148
Length on Template	5
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C2306_007

Type	Read
Score	52
Start on Template	113
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C2308_005

Type	Read
Score	31
Start on Template	161
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C2404_005

Type	Read
Score	45
Start on Template	3
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C2434_003

Type	Read
Score	62
Start on Template	131
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C337_021

Type	Read
Score	49
Start on Template	25
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C437_019

Type	Read
Score	92
Start on Template	206
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C447_016

Type	Read
Score	59
Start on Template	206
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C458_015

Type	Read
Score	63
Start on Template	141
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C523_011

Type	Read
Score	84
Start on Template	101
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C532_012

Type	Read
Score	70
Start on Template	103
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C538_016

Type	Read
Score	82
Start on Template	101
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C605_011

Type	Read
Score	80
Start on Template	66
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3477

Type	Read
Score	120
Start on Template	67
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	15
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1063_014

Type	Read
Score	66
Start on Template	101
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1372_014

Type	Read
Score	72
Start on Template	131
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1661_011

Type	Read
Score	76
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1795_012

Type	Read
Score	75
Start on Template	67
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1821_012

Type	Read
Score	63
Start on Template	0
Length on Template	9
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C2444_006

Type	Read
Score	55
Start on Template	47
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C231_020

Type	Read
Score	53
Start on Template	27
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C235_023

Type	Read
Score	72
Start on Template	101
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C248_018

Type	Read
Score	63
Start on Template	101
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C249_016

Type	Read
Score	74
Start on Template	101
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1077_011

Type	Read
Score	32
Start on Template	142
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1297_010

Type	Read
Score	74
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1957_013

Type	Read
Score	76
Start on Template	103
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C2012_011

Type	Read
Score	73
Start on Template	113
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C2615_007

Type	Read
Score	54
Start on Template	0
Length on Template	9
Start on Read	4
Length of Read	7
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C560_027

Type	Read
Score	69
Start on Template	47
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C210_016

Type	Read
Score	46
Start on Template	47
Length on Template	21
Start on Read	0
Length of Read	21
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3517

Type	Read
Score	46
Start on Template	47
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C163_020

Type	Read
Score	65
Start on Template	66
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C518_020

Type	Read
Score	50
Start on Template	49
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3530

Type	Read
Score	39
Start on Template	178
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	14
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C22_019

Type	Read
Score	48
Start on Template	186
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C61_021

Type	Read
Score	170
Start on Template	154
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	25
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C93_016

Type	Read
Score	40
Start on Template	40
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C374_018

Type	Read
Score	76
Start on Template	0
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C929_016

Type	Read
Score	36
Start on Template	136
Length on Template	7
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C189_027

Type	Read
Score	38
Start on Template	57
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	11
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3590

Type	Read
Score	43
Start on Template	68
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C839_018

Type	Read
Score	47
Start on Template	42
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1336_013

Type	Read
Score	37
Start on Template	133
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C238_022

Type	Read
Score	46
Start on Template	129
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1046_020

Type	Read
Score	29
Start on Template	148
Length on Template	5
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3718

Type	Read
Score	37
Start on Template	185
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C136_024

Type	Read
Score	53
Start on Template	27
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C313_023

Type	Read
Score	62
Start on Template	7
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	19
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C373_014

Type	Read
Score	30
Start on Template	204
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1029_008

Type	Read
Score	43
Start on Template	163
Length on Template	15
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3798

Type	Read
Score	68
Start on Template	47
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3799

Type	Read
Score	135
Start on Template	113
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C192_030

Type	Read
Score	43
Start on Template	211
Length on Template	6
Start on Read	0
Length of Read	7
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C313_024

Type	Read
Score	97
Start on Template	195
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C336_026

Type	Read
Score	91
Start on Template	9
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C201_029

Type	Read
Score	35
Start on Template	27
Length on Template	10
Start on Read	0
Length of Read	10
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C437_025

Type	Read
Score	96
Start on Template	9
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C587_015

Type	Read
Score	68
Start on Template	82
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C666_015

Type	Read
Score	58
Start on Template	50
Length on Template	30
Start on Read	0
Length of Read	26
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1541_017

Type	Read
Score	111
Start on Template	131
Length on Template	16
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C270_027

Type	Read
Score	38
Start on Template	129
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	8
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C402_021

Type	Read
Score	87
Start on Template	5
Length on Template	19
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C607_021

Type	Read
Score	94
Start on Template	97
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

Combined_3860

Type	Read
Score	68
Start on Template	35
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C862_011

Type	Read
Score	149
Start on Template	0
Length on Template	24
Start on Read	0
Length of Read	23
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C911_016

Type	Read
Score	163
Start on Template	0
Length on Template	26
Start on Read	0
Length of Read	26
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1499_009

Type	Read
Score	36
Start on Template	3
Length on Template	8
Start on Read	0
Length of Read	9
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1776_010

Type	Read
Score	41
Start on Template	148
Length on Template	11
Start on Read	0
Length of Read	13
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1944_009

Type	Read
Score	42
Start on Template	157
Length on Template	14
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C599_020

Type	Read
Score	80
Start on Template	97
Length on Template	17
Start on Read	0
Length of Read	16
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

C1277_011

Type	Read
Score	52
Start on Template	175
Length on Template	13
Start on Read	0
Length of Read	17
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1496_019

Type	Read
Score	55
Start on Template	47
Length on Template	12
Start on Read	0
Length of Read	12
Unique	No
Positional Score
Alignment graphic

C1510_010

Type	Read
Score	135
Start on Template	113
Length on Template	18
Start on Read	0
Length of Read	18
Unique	Yes
Positional Score
Alignment graphic

>REC-0-1_002 template
DFVLTQSPHSLSVTPGESASISCKSSHSLLHGDRSNYLAWYVQKPGRSPQLLIDLASERASGVPDRFSGSGSDKDFTLKISRVETEDVGTYYCMQGRESPWTFGQGTKVDIKRSLAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREALVNWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYTLNSTLTLLKAYYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFGRNEC
>C833_003 score:272 alignment:34M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VDNA.LQSGNSQESVTE.QDSK.DSTY.SLSS..TL.TLSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1309_003 score:54 alignment:8M2D12M1D2M1D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SEQH.LQ.D.F...EG.AVVVAGEFD....Q.GS.KDST~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C666_015 score:58 alignment:13M4D13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.KE.G.M.LCAG.ASGV....S....SCGCDKLPSDKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1499_003 score:54 alignment:1I14M1S[2,2]5M2D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KG.GSYVQ.DM.E.G.AVVV.SAGEFDQ......GSSSEK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1032_002 score:192 alignment:28M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VQWKVDNA.LQGDDGQESVTE.QDSK.DSTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1173_002 score:50 alignment:13M11D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EPAT....GSGSRYDDT............GTAY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1039_005 score:72 alignment:1I12M1S[1,2]15M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KGEEEEVVTC.EVVVA.GEFD.QGSS..TD.KLQK..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1283 score:52 alignment:9M3D10M1S[2,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SEQH.LQ.D.F.W....AVVVAGEFD....QGSSSKE~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C857_006 score:56 alignment:10M1D16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~STW.KLKDAEL...CAQSQSS.CMGDGSGPL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2079_002 score:53 alignment:8M1I11M2D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SEQH.LQ.D.FWAGVV.VAGEMDQ......GSSSEK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1602_005 score:93 alignment:13M3D8M1I3M unique:False
~~~~~~Q.SP.LSLSVT.PDPM.....SLPTYHELHLHG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1630_004 score:102 alignment:10M2D12M1I3M unique:True
~~~~~~Q.SP.LSLSVT.P..SAAD..LSPEYHTLHLHG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1141_009 score:52 alignment:15M1D10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLDAM.LCAGASGVSS.E.EDDK.VLDA.M~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C911_016 score:163 alignment:26M unique:True
~DFVLTQ.SP.HSLSVT.PDSSASS..SMESS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1421_002 score:144 alignment:12M1D12M unique:True
~DFVLTQ.SP.HSLW.T.PGESASL..SYEM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1042 score:146 alignment:25M unique:True
~DFVLTQ.SP.HSLSVT.PADSASL..GGGF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C201_003 score:162 alignment:9M1S[1,2]15M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KAAEQ.LQSGGGSQESVTE.QDSK.DSTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3695 score:190 alignment:3M1S[2,2]20M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KVDGQ.LQSGNSQESVTE.QDSK.DSTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C164_004 score:182 alignment:25M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KVGNQ.LQSGNSQESVTE.QDSK.DSTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C300_008 score:181 alignment:3M1S[2,2]20M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KVDGQ.LQSGNSQESVTE.QDSK.NSTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C479_005 score:152 alignment:3M1S[2,2]4M1S[1,2]15M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLDGQ.LQSGGGSQDGQTE.QDSK.DSTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1224_002 score:62 alignment:2I7M1S[2,2]16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~LGT.WLKDAS..SLCAQSQSS.CMGDSGGPL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C742_004 score:160 alignment:24M unique:False
~DLVLSQ.TP.LSLSVT.PGESASL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1583_004 score:54 alignment:5M2D17M unique:False
~~~~LTL.YD...LAHT.PGVAADL..SHLETK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C889_005 score:130 alignment:5M1S[2,2]2M1S[2,2]6M1S[2,2]2M1S[2,2]1M unique:False
~DLVLTS.QP.LTVSVT.PGEGTSL..CSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1594 score:152 alignment:5M1S[2,2]10M1S[2,2]5M unique:False
~DLVLTS.QP.LSLSVT.PGEGTSL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1707_004 score:54 alignment:5M2D17M unique:False
~~~~LTA.DY...LLHT.PGVAADL..SHLETK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1611_005 score:133 alignment:24M unique:True
~DLVLVE.SP.TLLGHT.PGESASL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1541 score:174 alignment:24M unique:False
~DLVLTQ.SP.LSLSVT.PGESASL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1869_006 score:50 alignment:4M9D11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.VV...............E...ALVLDQVEAR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C862_002 score:155 alignment:17M1S[2,2]5M unique:True
~DLVLTQ.SP.AQLSVT.PGEGTSL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1835_008 score:116 alignment:5M1S[2,2]2M1S[2,2]13M unique:False
~DLVLTS.QP.LTVSVT.PADSASL..SMN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C702_004 score:150 alignment:5M1S[2,2]14M1S[2,2]1M unique:False
~DLVLTS.QP.LSLSVT.PGESASL..CSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1342_004 score:145 alignment:12M1D11M unique:True
~DFVLTQ.SP.HSLW.T.PADSASL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C862_011 score:149 alignment:7M1D16M unique:True
~DFVLDQ.Q..HQLSVT.PGESASL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1233_002 score:142 alignment:24M unique:True
~DFVLDV.DG.HKVSVT.PGESASL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1324_003 score:161 alignment:8M1S[2,2]14M unique:True
~DFVLGE.EP.SHLSVT.PGESASL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C217 score:148 alignment:1S[2,2]22M unique:True
~FDVLGE.SP.HSLDAT.PGESASL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C256_003 score:147 alignment:24M unique:True
~DFVLTQ.SP.HSLSVT.PADSASL..NGF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C216_002 score:170 alignment:5M1S[2,2]1M1S[2,2]14M unique:True
~DFVLT.NTP.SHLSVT.PGESASL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1236_002 score:147 alignment:24M unique:True
~DFVLEA.DG.HKLSVT.PGESASL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C909_009 score:55 alignment:1I10M1S[1,2]13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KSGPDVTE.EVVVA.DAME.NGSS..SE.KLQ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1328_003 score:192 alignment:24M unique:True
~DFVLTQ.SP.HSLSVT.PGESASL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C61_021 score:170 alignment:2M1S[2,2]1I20M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VDGQKLQSGNSQESVTE.QDSK.DSTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2099_006 score:45 alignment:6M5D3M1D8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VVP.A..L..N......P...AL.QWPVLSG.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C839_005 score:50 alignment:5M1S[2,2]2M9D5M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ETVSE.ENSV.............L.CLSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C170_004 score:145 alignment:2I1M1S[2,2]20M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LKDGQ.LQSGNSQDGQTE.QDSK.DSTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C627_002 score:106 alignment:1I6M1D12M1I3M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KDNA.LQN.NSQESVTE.QNSHVEET~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1354_006 score:60 alignment:6I11M6D5M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AAALGLDLGTTYSMQGV.......FQGH..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C528_003 score:49 alignment:3M1S[2,3]17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AHCGVTDCVVG.L.S.V..MDQGSSSE.K~~~~~~~
>C1336_004 score:165 alignment:2I22M unique:True
~MEVLTN.SP.HSLSVT.PGESASL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1012_003 score:53 alignment:1I22M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~HDDD.TSSDVVVAGEFD.QGSK.DST~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C210_016 score:46 alignment:21M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLDL.SL.D.L.AEVK.AQMEMLAQK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C574_002 score:48 alignment:1I15M2D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MLQVSPYQVSVPY.QVS...SNG.S~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1527 score:46 alignment:3M1I10M2D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.C.EAV..TVLALGSA.V...SNGGAK
>Combined_1476 score:38 alignment:4M6D2M1D8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GVVD..........SD.DLPLNVSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1010 score:46 alignment:21M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLDL.SL.D.L.AEVK.AQMMELAQK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C271_003 score:159 alignment:21M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KVDNA.LQSGNSQESVTE.QNSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C290_004 score:100 alignment:21M unique:True
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGESASL..HGHTGPGE.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1433 score:160 alignment:20M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VDNA.LQSGNSQESVTE.QDSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1189 score:151 alignment:20M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VDNA.LQSGNSQESVTE.QNSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C415_002 score:68 alignment:9M5D6M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~SVT.PGESAS.......SHMT.PA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2627_003 score:49 alignment:2D10M3D5M unique:False
~ .VLDQ.DC.LMLS....GETAK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C119_010 score:135 alignment:7M1D12M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VDNA.LQT.NSQESVTE.QDSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1016_004 score:50 alignment:1S[2,2]7M4I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GTGEFDAFDAFDQGSSSEKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1430_005 score:51 alignment:11M2D6M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AL.VNF.C..L..NENS...E...ALVNW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1516 score:91 alignment:10M2D7M unique:False
~~~~~~Q.SP.LSLSVT.P..ECYL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C730_004 score:152 alignment:19M unique:True
~~~~~~Q.SP.HSLSVT.PGESASL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C98_013 score:133 alignment:1I19M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LDNA.LLSGNSQESVTE.QNSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1219 score:121 alignment:12M1S[2,2]2M1S[2,2]1M unique:True
~~~~~~Q.SP.LSLSVT.PGEGTSL..CSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1139 score:50 alignment:1S[2,2]4M1D12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GTGVMT.FD....KDQDDKDGTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1198_003 score:119 alignment:12M1S[2,2]2M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~Q.SP.LSLSVT.PGEASSL..CSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C463_005 score:112 alignment:8M2I11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~HKVPA.S.E.NMETHQGLSSP.VT.K~~~~~~
>C1229_002 score:96 alignment:14M1D4M unique:False
~~~~~~Q.SP.LSLSVT.PMSSM.L..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_264 score:42 alignment:10M4D5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AA..LQPAL..QPV.....LK.SGL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C402_021 score:87 alignment:13M1D5M unique:True
~~~~~~Q.SG.FSLSVT.PYGH.SL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1518 score:143 alignment:19M unique:False
~~~~~~Q.SP.LSLSVT.PGESASL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1510_010 score:135 alignment:18M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLAA..PSVFL..FPPS.NEQLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3799 score:135 alignment:18M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLAA..PSVFL..FPPS.DEQLQ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2481 score:48 alignment:3I8M1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSDVVVADAFDQ...GSTSDKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C679_002 score:90 alignment:18M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LGLRDPY.DVGTYYCMQGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_995 score:144 alignment:18M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLAA..PSVFL..FPPS.DEQLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1144 score:134 alignment:1S[2,2]16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TVAA..PSVFL..FPPS.DEQLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1023_005 score:107 alignment:1S[2,2]16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TVAA..PVTFV..FPPS.DEQLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C173_002 score:126 alignment:18M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LGRVEPY.DVGTYYSMQGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1546_003 score:45 alignment:18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AVC.L..H..RPTD.MEE...M~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3672 score:46 alignment:6M1D11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SN.DLTY..LTL..NN.DLTK..LL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1513 score:55 alignment:2I13M1S[2,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LLVDEA.LNEDNSVVSLSQ.PK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C754_005 score:132 alignment:5M1S[2,2]11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLAA..PVSFL..FPPS.DEQLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1823_005 score:89 alignment:1I18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DNYLAW.YVQK..P.G.RPAWA.LL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1602_011 score:87 alignment:8M1S[1,2]5M1S[2,2]2M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VQK..P.S.GRPAGL.LL.Y.L.GTSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1088_004 score:144 alignment:18M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DSK.DSTY.SLSS..TL.TLSK..A~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1868_005 score:52 alignment:8M5D5M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPQL.LL.D.G.......SQVGK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C195_002 score:94 alignment:18M unique:True
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGESAGP..LHQESH~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C163_003 score:93 alignment:1S[2,2]16M unique:True
~~~~~~~~~~~~TVTVS.PGESASL..HTHSSH~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_062 score:53 alignment:1I18M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MLQVSPYQVSVPY.QVSN.GS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C199_005 score:117 alignment:18M unique:True
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGESASL..SHTHSH~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C154_005 score:121 alignment:18M unique:True
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGESATL..SHHSSH~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2365_002 score:122 alignment:4M2I14M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLAFLMPSVFL..FPPS.DEQLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1572 score:132 alignment:14M1S[2,2]2M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLAA..PSVFL..FPPS.DQELK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1543 score:107 alignment:1S[2,2]16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TVAA..PSVFL..FGVM.DEQLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1627_005 score:46 alignment:3I18M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LLVDEALG.GED.NS.VVS.L..S..QPK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1008 score:105 alignment:14M1S[2,2]2M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLAA..PVTFV..FPPS.DQELK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1027 score:107 alignment:2M1D14M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VY..C.E.L..THQGLSSP.VT.K~~~~~~
>C607_021 score:94 alignment:8M1S[2,2]7M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPW.TFGQSA..K..VD.L.KVG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C313_024 score:97 alignment:6M1I11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.D.N.YM.THQGLSSP.VT.K~~~~~~
>C587_015 score:68 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VETE.DVGTYYDDRDPAD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C313_023 score:62 alignment:2I17M unique:False
~~~~~~~PGE.FSLSVT.PGYSLSG..GHY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C599_020 score:80 alignment:7M1D9M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QSPW.TFW.GT..K..VD.L.KVG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1228_005 score:58 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EKY.DGTL.TLNN..DL.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2429 score:63 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DSK.YNSL.TLNN..DL.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C336_026 score:91 alignment:17M unique:True
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGESASD..SGPHM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C685_004 score:118 alignment:17M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.A.C.V..THQGLSSP.VT.K~~~~~~
>Combined_2490 score:53 alignment:1I17M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KEQLF.QEN.GE.LVD.L..R..NDF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2012_011 score:73 alignment:2M2D5M2I4M1I4M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL....PSVFPSVFPPSVDEQL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C192_010 score:118 alignment:17M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.C.E.V..THQGSSLP.VT.K~~~~~~
>Combined_1147 score:109 alignment:17M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYG.D.M.V..THQGLSSP.VT.K~~~~~~
>C341_006 score:43 alignment:8M1D8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.LA.P.V.AEE..AETVPNNK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C176_006 score:98 alignment:2S[2,2]13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YVC.A.E.V..THQGVSTP.VT.K~~~~~~
>Combined_1449 score:109 alignment:17M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYV.C.A.E..THQGLSSP.VT.K~~~~~~
>C2100_003 score:50 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.GVH.H..Q..DLHG.PYR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1367 score:106 alignment:6M1I11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.S.E.NY.THQGLSSP.VT.K~~~~~~
>Combined_2877 score:124 alignment:10M1S[2,2]5M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.C.E.V..THQGSLSP.VT.K~~~~~~
>C240_007 score:118 alignment:17M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.A.E.M..THQGLSSP.VT.K~~~~~~
>C347_010 score:96 alignment:4M1I1S[2,2]11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYG.YY.DL..THQGLSSP.VT.K~~~~~~
>C948_004 score:51 alignment:1I8M2D7M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AE.QDSK.GDD...LST..AL.LK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1758 score:89 alignment:9M1D7M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.LL.D.L.ASEN..SLRPDRF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1453 score:43 alignment:11M1D5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.LA.P.V.AEEE.AT.VPNNK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C642_003 score:106 alignment:3M1I14M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYAGC.C.Y..THQGLSSP.VT.K~~~~~~
>C623_006 score:97 alignment:1S[2,2]15M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YVE.D.E.M..THQGLSSP.VT.K~~~~~~
>C505_008 score:106 alignment:4M1I13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.GSE.M..THQGLSSP.VT.K~~~~~~
>C1116_006 score:88 alignment:8M1D1S[2,2]6M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.LL.D.L.ASE..TGRRPDRF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1589_004 score:75 alignment:7M1D9M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.LL.D.L.AT.R.DNVTPDRF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C80_005 score:97 alignment:1S[2,2]15M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YVM.G.D.V..THQGLSSP.VT.K~~~~~~
>C1423_005 score:89 alignment:12M1D4M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.LL.D.L.ASER.GKE.PDRF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1298_005 score:89 alignment:12M1D4M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.LL.D.L.ASER.NVT.PDRF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C187_005 score:66 alignment:12M1D4M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYM.G.D.V..THQSKE.P.VT.K~~~~~~
>C162_005 score:118 alignment:17M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYV.C.E.A..THQGLSSP.VT.K~~~~~~
>C2056_007 score:91 alignment:1I10M1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DNYLAW.YVQK..PVG.RVPEL.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C508_010 score:71 alignment:11M2D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VETE.DVGTYYH..GDYT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C681_002 score:109 alignment:17M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYS.A.E.E..THQGLSSP.VT.K~~~~~~
>Combined_1269 score:97 alignment:6M1I11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.D.D.YM.THQGLSSP.VT.K~~~~~~
>C598_005 score:97 alignment:6M1I11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.T.D.CY.THQGLSSP.VT.K~~~~~~
>Combined_3509 score:91 alignment:17M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SRLMYY.DVGTYYCMQGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_071 score:136 alignment:17M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.C.E.V..THQGLSSP.VT.K~~~~~~
>C657_005 score:99 alignment:1I17M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYYN.S.M.V..THQGLSSP.VT.K~~~~~~
>Combined_693 score:44 alignment:7M3D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SS..TS.TSS.....YSTPGVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2736 score:65 alignment:16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVS.Q..L..TMQR.PY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1546 score:108 alignment:11M1S[1,2]4M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVS.E..L..NGGFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2199_002 score:109 alignment:8M1I3M1S[1,2]4M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TGT.AS.VVCHL..L..NGGFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C510_006 score:96 alignment:16M unique:True
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGESASL..THEC~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1865_007 score:50 alignment:1I14M1S[1,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KPAE...ALVNSMVQQT.LAAN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C820_006 score:121 alignment:11M1S[1,2]4M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVC.L..L..DGGFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2044_006 score:96 alignment:16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TGS.AS.VVC.L..L..NNYM.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1484_002 score:63 alignment:1I16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSK.YSDL.TLDN..NL.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C505_002 score:45 alignment:3I6M1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VDVVADAFDQ...GSSSEKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C907_005 score:56 alignment:1M1S[2,2]11M1I2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SAS.AS.VVS.D..L..DGPHMPR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1930_005 score:46 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DSQWVVDE.DDSQ.WVVS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2754_002 score:110 alignment:16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AN.AVC.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2052_005 score:101 alignment:16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVA.Q..Q..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1538_013 score:44 alignment:1S[1,2]15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AGLF.LEG.NE.LVD.L..R..NDF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1408 score:98 alignment:1S[2,2]14M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSS.AS.LVC.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C443_009 score:49 alignment:4I9M1S[2,2]5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSDVVVA.G.E.F..DKEAVSTD.VD~~~~~~~~
>C850_004 score:56 alignment:1M1S[2,2]11M1I2M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SAS.AS.VST.L..L..DGPHMPR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C715_004 score:54 alignment:1I3M2D9M1I2M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TSGT....VVC.L..L..DGPHMPR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1159 score:105 alignment:16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVC.L..L..DLMY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1230_003 score:85 alignment:1S[2,2]7M2I7M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GST.AS.VVG.DDHL..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1491_009 score:59 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSK.YSNL.TLDN..NL.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1428 score:119 alignment:16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVT.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2021_004 score:123 alignment:16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVC.L..L..NDFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1130 score:118 alignment:1M1S[2,2]13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SAS.AS.VVC.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C820_005 score:116 alignment:1M1S[2,2]8M1S[1,2]4M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SAS.AS.VVC.L..L..NGGFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C675_004 score:107 alignment:11M1S[1,2]4M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TGS.AS.VVC.L..L..DGGFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1231 score:123 alignment:16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVC.L..L..DNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1042 score:104 alignment:3M1S[2,2]11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TGS.GT.VVC.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C279_010 score:74 alignment:16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VETE.DVGTYYMATGVD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1571 score:114 alignment:16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TGS.AS.VVC.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_984 score:67 alignment:1I16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSK.YSDL.TLNN..DL.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1426_005 score:63 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSK.YSNL.TLNN..DL.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C134_019 score:110 alignment:16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YV.C.E.L..THQGLSSP.VT.K~~~~~~
>C283_006 score:115 alignment:4I16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LREQLQSGNSQESVTE.QNSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1733_003 score:50 alignment:1I3M1S[1,2]12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LL..GSGLSSSSV.LHGMVFK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2247 score:67 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QSK.FSDL.TLNN..DL.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1541_017 score:111 alignment:14M1S[2,2] unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVC.L..L..DNFY.RP~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C102_003 score:80 alignment:5M1I11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~RVTMYYDVGTYYCMQGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C437_025 score:96 alignment:16M unique:True
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGESASL..ENHM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_076 score:96 alignment:16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPW.TFGQGT..K..VD.K.LR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2541_002 score:95 alignment:1M1S[2,2]13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SAS.AS.VVC.L..L..DMLY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1565 score:46 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TG.ELLS..GL.HLEA..LYGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2631_002 score:88 alignment:10M2S[1,2]4M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VGR.F..M..GGGGFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C865 score:95 alignment:6I16M unique:True
~~~~~~GGGGGFSLSVT.PGESASL..SYEM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2346 score:43 alignment:2I8M2D6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DGEE.AVLVPG..S....GPGSW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C932_003 score:104 alignment:8M1S[2,2]6M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPW.TFGQSA..K..VD.L.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_072 score:95 alignment:1I1S[1,2]15M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VGLREPY.DVGTYYCMQGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1245 score:46 alignment:1I16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QAA..PCVLF..FDEL.DSLAK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C703_004 score:95 alignment:11M1S[1,2]1S[2,2]2M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TGS.AS.VVC.L..L..DGGYF.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C647_004 score:92 alignment:16M unique:True
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGESASL..MGCY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_077 score:114 alignment:16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPW.TFGQGT..K..VD.L.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C615_006 score:46 alignment:16M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GVPVRDP....ATGYTLEFR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C193_002 score:104 alignment:1I1S[1,2]15M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VGLREPY.DVGTYYSMQGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1143_012 score:102 alignment:10M1I6M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPW.TFGQGTG.K..VD.L.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1035_002 score:83 alignment:16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSHSL.LHESDHSYLAW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2709_002 score:110 alignment:16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVS.E..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1005 score:128 alignment:16M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVC.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2691_002 score:104 alignment:2I1M1S[2,2]2M1I11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSSAS.ASSVVC.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C458_006 score:73 alignment:10M1D4M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.D.L.ASER.GKE.PDRF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1505_005 score:43 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SVLL..EAFSSPSD.LEK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1062_006 score:47 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.SKNY.TLNN..DL.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C782_003 score:100 alignment:1I1S[2,2]13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NAS.AS.AVC.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C610_006 score:51 alignment:4I8M1S[2,2]5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YHTSQSGDEMTSLSE.YVSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2204_002 score:39 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A..VFVDL..EPSL.VEQVR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C489_005 score:88 alignment:15M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VETE.DVGTYYTNMGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C268_004 score:43 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSSEKLLKQKLAKVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2584 score:53 alignment:1I3M1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~ESVTRPPEQASL..PLLSN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C338_005 score:44 alignment:1I2M1S[2,2]11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FS.VCV.L..G..ENQH.CDE...AK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1137_003 score:43 alignment:3M1S[3,3]9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VG.TVC.N..H..NDGE.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C188_005 score:98 alignment:8M1S[2,2]2M1S[2,2]1M unique:True
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGEGTSL..CSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C507_005 score:75 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VETE.DVGTYYAEMER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1584 score:100 alignment:1I1S[2,2]13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GAS.AS.VVM.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2437 score:53 alignment:6M1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SN.DLTYLTLNN..DL.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C477_005 score:102 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLKLSRLESE.DVGTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_899 score:108 alignment:12M1S[2,2]1M unique:True
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGESASL..CSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1977_005 score:47 alignment:1I12M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSK.YSDL.TLNN..DLKTLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1859_009 score:55 alignment:1I15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSK.YSNL.TLNN..DL.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C366_015 score:46 alignment:2I15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TYQV..P.Y.QVPYQ.VS.D.L.NS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_080 score:79 alignment:15M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPW.TFGQSG..K..LD.L.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C661_015 score:96 alignment:1S[2,2]13M unique:True
~~~~~~~~~~~~TVTVS.PGESASL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3477 score:120 alignment:15M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S....GSGSDKDFTLKLSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3530 score:39 alignment:1I8M2D5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TTLEE..LL.PL....KNYEK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1033 score:102 alignment:15M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLSS..TL.TLSK..GEYEK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C160_003 score:116 alignment:4I15M unique:True
~~~~~~~~VGEMSLSVT.PGESASL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C839_018 score:47 alignment:7M1S[1,2]1M1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QA..S.S.GSPAGLRLL.V.Q.AT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1029_008 score:43 alignment:1I7M1I1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VSLSSVTVGNEQK.SNTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1025 score:120 alignment:15M unique:True
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGESASL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C116_003 score:101 alignment:1I15M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DTPW.TFGQGT..K..VD.K.LR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C105_002 score:65 alignment:1S[2,2]13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LDTE.DVGTYYAEMER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C240_004 score:65 alignment:1S[2,2]13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LDTE.DVGTYCYCVGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1274 score:92 alignment:1S[2,2]13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LDTE.DVGTYYCMQGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C202_004 score:65 alignment:1S[2,2]13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LDTE.DLGTYYCPMGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1137 score:102 alignment:15M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VETE.DVGTYYCMQGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C711_010 score:93 alignment:1S[3,3]12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KTLLSRVETE.DVGTY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1321_006 score:47 alignment:15M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AVC.L..P..DDEH.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2052 score:120 alignment:15M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DSTY.SLSS..TL.TLSK..A~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_895 score:120 alignment:15M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.C.E.V..THQGLSSP.VT.K~~~~~~
>C415_012 score:40 alignment:1I7M1D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VVVA.G.E.F..D.QGSSSE.K~~~~~~~~~
>C860_006 score:91 alignment:12M1S[1,2]2M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VETE.DVGTYYMCGAGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C185 score:111 alignment:15M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VETE.DVGTYYSMQGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2322_002 score:45 alignment:1I1M1S[2,2]11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~APER...ALVNSMVQQT.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1457_005 score:37 alignment:11M1D2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TG.ELLS..AV.HLE...AY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1944_009 score:42 alignment:2I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VTA.LVNGNVQHVVDA.N~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1837_004 score:41 alignment:4M1D2M1S[1,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LL.D.G..EEAV.AETHPW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C737_007 score:47 alignment:2I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LQQA.SL.P.L.LSER.YSPL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C968_006 score:47 alignment:2I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~HFSCSL.LNEDGLNENW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C755_007 score:84 alignment:3M1S[2,2]9M unique:False
~~~~~~~~~~~~SLSLS.PADSASL..SC~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1835 score:85 alignment:14M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..L..NNFY.PTR...NLVQW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C332_002 score:40 alignment:7M1D3M1D2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~G.ATQQL.L..D.E.A.ER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1685 score:43 alignment:1I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~NGEEAVL..VPGSWPSM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1421_008 score:49 alignment:3I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~KNSYNSL..TLNTSHTL.LK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1659 score:45 alignment:1I7M1S[2,2]5M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LRE...LLVDWVKDWV.AN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C248_018 score:63 alignment:6M2I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGTGGK..VD.L.GKVG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_362 score:44 alignment:3M1S[3,3]8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TTAP..SAVML..PSAS.D~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C734_017 score:67 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..K..VD.V.GKLN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1806 score:43 alignment:1I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ADFDQ....GSSSEKLQKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C223_018 score:73 alignment:6M1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGTG.K..VD.L.KNVG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2163_004 score:101 alignment:2I14M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ASS.AS.VVC.L..L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C896_007 score:41 alignment:1I5M1D8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VGVDSE.DLPLNLSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1499 score:46 alignment:11M1D2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TG.ELLS..GL.HLE...AY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1316 score:46 alignment:3M1S[2,2]9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GVVDSEDLPLNLSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C541_009 score:89 alignment:12M2I2M unique:True
~~~~~~~~~~~~SLSVT.PGETASLHSEC~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2466 score:38 alignment:6M1D7M unique:False
~~~~~~~~ST.CSTS.T.PGVSFR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C209_011 score:58 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSQSL.LHGDQSGMK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1629_007 score:94 alignment:14M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DSTY.SLSG..ML.TLSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1705_004 score:49 alignment:3I7M1S[2,2]5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VLSG.QSQVE.L.VE.V.ATEK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2649 score:40 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.Q.Q.ASLP.LGQTPDR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C109_002 score:40 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~SQWVV.CGHSHSL..PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C168_006 score:58 alignment:14M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSHSL.LGGHLLSYE~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1098_004 score:47 alignment:2I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ASS.AS.VVT.D..E..LMVY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2868 score:43 alignment:1I1M1S[1,2]12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LT..AV..VN.W.VESLAA..AAN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C699_002 score:39 alignment:14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LLSW.YD.NEFGSNYR
>C2865_002 score:46 alignment:3I14M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LQQASL..PLLSNHSS.LKN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1113 score:112 alignment:14M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DSTY.SLSS..TL.TLSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C133_012 score:86 alignment:13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLSK..GYEEKHKVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C615 score:65 alignment:2M1S[2,2]9M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..NFNY.PTR...NLVQW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C56_002 score:59 alignment:13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLSK..KADYQHKVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1287_004 score:79 alignment:2M1D10M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QT.QL.LL.D.L.ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C538_016 score:82 alignment:6M2I7M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGTGGK..VD.L.KRN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C176_004 score:77 alignment:13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSHSL.LHGDNNRY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C447_016 score:59 alignment:13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSP.VT.KSSRLSCC
>Combined_1850 score:104 alignment:13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSP.VT.KSFGRNEC
>C373_014 score:30 alignment:4M5D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GLSG.......FYRN~
>C437_019 score:92 alignment:5M1I8M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSP.VTGKSFGRNEC
>C1345_004 score:90 alignment:13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QSPQL.LL.D.L.ATDR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1436_004 score:44 alignment:1I8M3I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AL..VNFC.LNEDNVALVNW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_510 score:50 alignment:13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AVC.L..Y..NSD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1496 score:40 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GNPTVEVDL.FTSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1720 score:95 alignment:13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLSK..ADYEKHKVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1617_003 score:41 alignment:10M2I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AVC.L..HGMDNW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3653 score:38 alignment:3M1I10M unique:False
~~~~LQQASL.PLLSNT.GG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C163_020 score:65 alignment:9M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FS....GSGSTEQTFLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1534 score:42 alignment:1I4M2D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QL..FHP...EQLL.TGK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C595_005 score:38 alignment:1S[1,2]12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AGGLETL.AN.ESMMR~~
>C2097_005 score:67 alignment:1I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSSY.SLGA..FL.TLSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C295_010 score:45 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AVC.L..N..YDS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C249_016 score:74 alignment:7M1I6M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..EL.VD.L.KRN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_970 score:104 alignment:13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FS....GSGSDKDFTLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C169_009 score:77 alignment:13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSP.VT.KSGLRMEC
>C1277_005 score:65 alignment:2M1D10M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QT.QL.LL.D.L.ATDR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1887_006 score:39 alignment:2I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LRAE...ALVNGMVQQT.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C398_010 score:43 alignment:1I1S[2,2]11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~ASL.PLLSARE..TCKY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_963 score:104 alignment:13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~SVT.PGESASL..SCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C191_002 score:43 alignment:7M2D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.AVMR.LE..PDRF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3590 score:43 alignment:2I5M1S[1,2]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GDPSGSPAVDRVLVLG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1795_012 score:75 alignment:9M1D3M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S....GSGSDKDF.LYL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C49_002 score:59 alignment:2I4M2D7M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SKTLEG....YEKHKVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C100_007 score:86 alignment:13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLSK..AYEDKHKVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1424 score:40 alignment:1I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSGSLLNELLGLVR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2251 score:45 alignment:10M2I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SQT.VS.AVC.L..PHEDDF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3449 score:86 alignment:13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..K..VD.N.KRL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C274_023 score:56 alignment:7M1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..EL.VD.K.LRN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2716 score:39 alignment:2I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VTALVDWVWDVA.AAN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C192_022 score:77 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ASGVPDRFS....SNRS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C520_009 score:41 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLDMA.LCAGASGV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C262_011 score:77 alignment:13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSQSL.LHGDNRNY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1916_016 score:45 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SNL.TLND..NL.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3805 score:95 alignment:13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FS....GSGSNKDFTLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C227_016 score:83 alignment:6M1I7M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGTG.K..VD.L.KRN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C208_025 score:83 alignment:6M1I7M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGTG.K..VD.L.KRG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1586_007 score:40 alignment:1I6M2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VFQQGD..QELVD.L.NRFD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C232_008 score:68 alignment:13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLSK..SEMDKHKVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C215_003 score:77 alignment:13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLSK..AEDYKHKVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1411 score:94 alignment:1I13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSSY.SLSS..TL.TLSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C236_021 score:73 alignment:4M1S[2,2]1I7M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQSAN.K..VD.L.KRN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C535_010 score:74 alignment:7M1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..KN.VD.L.KVG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1277_011 score:52 alignment:2I7M2I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YNSLY.SLTLNNDL.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C134_005 score:77 alignment:13M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSHSL.LHGDRPMY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1166 score:39 alignment:2I13M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LKDMA.LACGASGVSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C3052 score:43 alignment:2I11M1S[1,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VTALVNWVVTQA.AAAN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3521 score:66 alignment:8M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPQL.LL.Y.L.SASR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1553_006 score:69 alignment:12M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPQL.LL.D.L.PGDR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1619_009 score:53 alignment:1I12M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSL..TLNTSHTL.LK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1169 score:72 alignment:1I4M1S[1,2]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DNYLAAM.YVQK..P.G.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C447_005 score:60 alignment:1I9M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NDYLAW.YVQK..G.P.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C235_023 score:72 alignment:6M1I4M1I2M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGTG.K..VD.LGKR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1684_010 score:42 alignment:12M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ALVNWVVYNW.AN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C922_014 score:40 alignment:8M1S[1,2]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AS.LPL.L..S..NGGFA.N~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1988_011 score:54 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NTL.TLNN..TL.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2876 score:57 alignment:1I6M1D5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSPQL.LY...L.ASSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C402_005 score:70 alignment:1I4M1S[1,2]2M1S[1,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DNYLAAM.YVGAK..P.G.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3499 score:69 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPQL.LL.Y.L.SSAR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_666 score:55 alignment:11M1S[1,2] unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSDKDLQPVLSGL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C268_008 score:68 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNYLNF.YVQK..P.G.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C549_018 score:60 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPQL.LL.Y.L.SGTR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3446 score:59 alignment:1I12M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~HSSSL.LHGDDRLY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C242_009 score:60 alignment:1I4M1S[1,2]1S[2,2]5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNYLAAM.VYQK..P.G.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2265_003 score:39 alignment:3I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLAE...ALVNNMVQQT.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3525 score:36 alignment:2M1S[2,2]8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~THVT.LFGDELCK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_893 score:96 alignment:12M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..K..VD.L.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1220_013 score:84 alignment:9M1I3M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..K..VDNL.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C351_011 score:42 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DAMLK.LCQ.AS.GV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2711 score:53 alignment:1I12M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSL..TLNSTHTL.LK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2348 score:55 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL.SLNN..DL.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1969_009 score:84 alignment:4M1S[2,2]6M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQTG..K..VD.L.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C337_021 score:49 alignment:2I12M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AGSHSL.LHPSHSYY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1112 score:65 alignment:1I9M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNYLAW.YVQK..G.P.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1477_005 score:56 alignment:1I5M1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNYLASEYVQK..P.G.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2745 score:52 alignment:2I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YNSL..TLNTSHTL.LK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2161 score:67 alignment:5M1S[2,2]1M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DFTLKSLRLDTE~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C360_015 score:84 alignment:7M1I5M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..KN.VD.L.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_894 score:96 alignment:12M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S....GSGSDKDFTLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C523_011 score:84 alignment:9M1I3M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..K..VDGL.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3416 score:66 alignment:6M1I6M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGTG.K..VD.K.LR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2731 score:41 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KDAMLL.CGA.AS.GV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1309_008 score:41 alignment:8M1S[2,3]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GE.AF.VVG.V..VAGEF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C239_006 score:67 alignment:1I6M1S[2,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNYLAW.YNLK..P.G.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1063_014 score:66 alignment:7M1I5M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..KG.VD.R.KL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1122 score:77 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNYLAW.YVQK..P.G.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1091 score:96 alignment:12M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPQL.LL.D.L.ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1134 score:87 alignment:12M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SFQL.LL.D.L.ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_400 score:47 alignment:3I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LLSSKY.TLNN..DL.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C585_004 score:51 alignment:12M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNFY.SSR...LHVQW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3394 score:84 alignment:6M1I6M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGTG.K..VD.L.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C854_004 score:78 alignment:12M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPQL.LL.D.S.ALER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1225 score:84 alignment:8M1S[2,2]2M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPQL.LL.D.L.SAER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C560_027 score:69 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPQL.LL.Y.L.GSTR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1336_013 score:37 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~D.VG.VLL.L..T..NNAY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C902_004 score:42 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPQL.LL.N.D.VVDK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C656_004 score:39 alignment:8M1I4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LK.D.M.ALCAGASGV~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1496_019 score:55 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPQL.LL.Y.L.RTGS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3798 score:68 alignment:8M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPQL.LL.Y.L.GTSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C114_002 score:42 alignment:2I7M2D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DQGSSSEKQ..LKL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1013_005 score:77 alignment:1I12M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNYLFN.YVQK..P.G.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C389_002 score:69 alignment:12M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~SVT.PGESASQ..RF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2508_002 score:51 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPQL.LL.D.K.QDGK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C163_005 score:41 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DQGESSP.AT.SRLN~~~
>C2273_003 score:51 alignment:12M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.LL.D.L.LSES.PLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2266 score:51 alignment:12M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPQL.LL.D.M.SPLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1558 score:40 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GTL.ELLS..DV.QLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1552 score:46 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A..FSVFL..FNTE.NK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3804 score:84 alignment:8M1S[2,2]2M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S....GSGSDKDTFLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1533 score:48 alignment:6M1I6M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPGP.HVVD.L.ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1718_005 score:55 alignment:1I9M2I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNYLAW.YVQTMMP.G.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3860 score:68 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNYLAW.YVQK..P.R.G~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_635 score:39 alignment:1I8M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GGSGT..P..VD.D..RDL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3396 score:78 alignment:12M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..K..VD.K.LR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1316_004 score:65 alignment:1I9M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DNYLAW.YVQK..G.P.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C265_004 score:37 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QSANTPGRPTT.Q~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1487 score:72 alignment:1I4M1S[1,2]7M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DNYLSAM.YVQK..P.G.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1318 score:77 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DNYLAW.YVQK..P.G.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C90 score:46 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~V..ATVGLTVP.VT.R~~~~~
>C1079_002 score:56 alignment:1I5M1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GNYLAGFYVQK..P.G.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1288 score:51 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ASL..NWDSYPSL.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C865_003 score:51 alignment:12M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPQL.LL.D.G.ENKK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1164 score:56 alignment:1I5M1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNYLASMYVQK..P.G.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_054 score:78 alignment:12M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPQL.LL.Y.L.ASSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C506_006 score:56 alignment:1I9M1S[2,2]1M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNYLYL.YVQK..G.P.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C969_004 score:86 alignment:8M1S[2,2]2M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPQL.LL.D.L.GTER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C603_005 score:68 alignment:1I12M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNYLCL.YVQK..P.G.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3517 score:46 alignment:12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLDL.SL.D.L.AEVK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C319_007 score:68 alignment:1I12M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNYLAD.YVQK..P.G.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C374_018 score:76 alignment:4M1S[2,2]5M unique:True
~DFVLQT.SP.HSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C22_019 score:48 alignment:2M2I9M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SKTLAQDYKHKVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C118_007 score:43 alignment:4M1I4M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPSMTFGQSA..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C359_010 score:60 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QSTGF.TFGQGT..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C442_014 score:53 alignment:3M1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VQSR.P.G.LEPQL.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1138 score:62 alignment:8M1S[2,2]1M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPW.TFGQTG..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C175_008 score:44 alignment:3I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GYPVTH.QDEK.PGVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1623 score:37 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSNTDKDDTNSA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1030 score:69 alignment:3M1S[1,2]7M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPAM.TFGQGT..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1689 score:34 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ALVNAQVHQT.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C383_022 score:76 alignment:6M1I5M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGTG.K..VD.L.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C93_016 score:40 alignment:6M1I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YVQK..P.PVQKPSN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1277 score:53 alignment:4M1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPSMTFGQGT..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C488_005 score:78 alignment:9M1S[2,2] unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VYA.C.E.V..THQAV~~~~~~~~~~~~~~
>C852_005 score:58 alignment:1S[2,2]9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LYAW.YVQK..P.G.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_967 score:88 alignment:11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGT..K..VD.L.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_050 score:74 alignment:11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPW.TFGQGT..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1297_010 score:74 alignment:11M unique:True
~DFVVDQ.SP.HSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1630 score:40 alignment:2I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YNSL..TLDSYNTL.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C263_007 score:39 alignment:4M1I1S[2,2]5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSSPASL.HAFLR~~
>Combined_3471 score:88 alignment:11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FGQGT..K..VD.L.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C178_022 score:65 alignment:11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VQK..P.G.EKPNL.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1776_007 score:41 alignment:5M1D5M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ALVNW.VDYT.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C708_014 score:66 alignment:4M1S[2,2]3M1S[2,2] unique:True
~DFVLQT.SP.HVT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C171_021 score:36 alignment:6M1S[2,2]1M1S[2,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QPA.TGT.GT.RAM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1567_011 score:38 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~P.A.LEPVL.LS.G.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1532_011 score:37 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL..TLDHEPTL.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1493_010 score:38 alignment:11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ALVNGQHENV.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C962_011 score:38 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SNL.TLNN..NL.TL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1776_010 score:41 alignment:2I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VTALVQGMVQQT.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2884 score:60 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LPQS.LL.Y.L.ASSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3706 score:58 alignment:3M1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PQLSLL.Y.L.ASSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C798_006 score:34 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.LHGVMMMHR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C770_003 score:42 alignment:11M unique:False
~~~~LDQ.PM.TELSVR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1506_003 score:79 alignment:11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QSPW.TFGQGT..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_853 score:68 alignment:2M1D8M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FL...PPS.DEQLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2713 score:78 alignment:1I11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LPQS.LL.D.L.ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2080_003 score:70 alignment:11M unique:False
~DLVLTQ.SP.LSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C385_020 score:61 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TFGQGS..L..KD.L.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_891 score:42 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DQGSSTL.QDQK.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1077_011 score:32 alignment:6M1D4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NSQ.VRP....LVQW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1924_005 score:38 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ALVMANVEQT.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1244 score:87 alignment:1I11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DPQL.LL.D.L.ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1183 score:86 alignment:2I11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GAPQL.LL.D.L.ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C575_003 score:34 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KMGDSL.PMGDA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1700_002 score:32 alignment:3M1D7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ALV.WDVQET.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C293_008 score:50 alignment:5M1D5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SER.FP.VPDRF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1697_010 score:67 alignment:1D7M1I3M unique:True
~ FVLTQ.SPGHSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_395 score:88 alignment:11M unique:True
~DFVLTQ.SP.HSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1938_002 score:40 alignment:2I4M1S[1,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PAL.EEEAV.PSGWPW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C606_009 score:32 alignment:6M2D3M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNMY.QS.....LVQ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C798_009 score:34 alignment:9M1S[2,2] unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GPTSL.QD.KTGF~~~
>Combined_1538 score:87 alignment:1I11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NPQL.LL.D.L.ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1661_011 score:76 alignment:8M1I3M unique:True
~DFVLTQ.SPGHSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1814 score:36 alignment:5M1D5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ALVNW.VYDT.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_497 score:37 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~CEPA.LQKGFSGL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1535_004 score:43 alignment:11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ALVNNHTDNV.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C189_027 score:38 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EP.ATGTGDRGF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C132_008 score:57 alignment:3M1S[1,2]4M1S[2,2]1M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPAM.TFGQTG..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_941 score:47 alignment:11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TL.SLNN..DL.TLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1424_003 score:50 alignment:2I11M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LGPHA.VV.D.L.ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1626_006 score:41 alignment:2I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DLP.G.QGSSL.LS.T.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C635_010 score:38 alignment:5M1S[1,2]5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~D.L.AANVA.AVGAK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3080 score:42 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DS..LL.AEVK..AQYE~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1712_011 score:76 alignment:4M1S[2,2]5M unique:True
~DFVLQT.SP.HSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C674_005 score:64 alignment:8M1S[2,2]1M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESPW.TFGQSA..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C497_005 score:35 alignment:1I2M1D8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLE.VELE.PVGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C261_016 score:51 alignment:1I11M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ESVGM.TFGQGT..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1420_004 score:39 alignment:2I5M1I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FHQL.DL.DDL.QSLR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_389 score:44 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YCMQGSREPW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C518_020 score:50 alignment:6M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QL.LL.Y.L.SASR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C16_006 score:62 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSQSL.LHGDR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1957_013 score:76 alignment:4I10M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QPGLGQGT..K..VD.L.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2796_004 score:78 alignment:2I10M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AYQL.LL.D.L.ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1097_004 score:34 alignment:1I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GL.GL.D.D.ALEP.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3365 score:71 alignment:10M unique:True
~DFVLTQ.SP.HG~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C933_003 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VETE.DTHGYM~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1710_006 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~T.AS.DVV.V..L..EF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1028 score:62 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LAW.YVQK..P.G.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C744_003 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VCPA.LQPVLS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C231_020 score:53 alignment:10M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.LHGDNNRY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1041 score:44 alignment:10M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLSS..TL.VQKW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C175_021 score:36 alignment:7M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EP.ATGTNRDF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C201_029 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.LHYHAGQY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C423_018 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QK.LL.K.L.AKVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C103_029 score:37 alignment:7M1D2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EP.AT.GSF.RN~
>C2140_010 score:41 alignment:2I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~WLTLNE..NL.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1443_012 score:55 alignment:2I10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ELTLSL..TL.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_933 score:80 alignment:10M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVC.L..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C136_024 score:53 alignment:10M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.LHGAQHYY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1146_002 score:70 alignment:6M1S[2,2]2M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QL.LL.D.L.GTER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3001 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ALVQDWVQTL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2077 score:39 alignment:8M1S[1,2]1M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.LT.D.N.AYCGL.A~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1760_004 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLP.MT.VDFLR~~
>C306_004 score:62 alignment:10M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GQGT..K..VD.K.LR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3412 score:44 alignment:10M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~PAL.QL.G.L.ASF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1444 score:53 alignment:10M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.TLDN..AYMEK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3841 score:68 alignment:1S[2,2]8M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GST.AS.VVC.L..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C532_012 score:70 alignment:1I10M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QGFGT..K..VD.L.KR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1172 score:68 alignment:6M1S[2,2]2M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QL.LL.D.L.SAER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2434_003 score:62 alignment:10M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VPA.L..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C445_004 score:44 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YCMQDRASPW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1154 score:80 alignment:10M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QL.LL.D.L.ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_324 score:34 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~EVSL.EDSK.AF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1000_009 score:62 alignment:10M unique:True
~DFVLTQ.SP.GH~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C167_016 score:35 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.LQSPKQQQQ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1197 score:80 alignment:10M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..FPPS.DEQLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C234_006 score:44 alignment:10M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.LHGPHTYY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C605_011 score:80 alignment:10M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FS....GSGSDKDF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C458_015 score:63 alignment:9M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNFY.PRE...AK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C128_002 score:34 alignment:2I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QLQN.LL.Q.T.ASR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C869_005 score:63 alignment:1D8M unique:True
~ FVLTQ.SP.H~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1017_014 score:61 alignment:2I9M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MEA.E.E.V..THQGL~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3385 score:72 alignment:9M unique:True
~DFVLTQ.SP.H~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2308_005 score:31 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GVPQLEVTF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1821_012 score:63 alignment:9M unique:True
~DWVLTQ.SP.H~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1014 score:63 alignment:9M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ADYEKHKVY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2615_007 score:54 alignment:2D7M unique:True
~ .VLTQ.SP.H~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_962 score:62 alignment:7M1S[2,2] unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.C.E.V..THQVA~~~~~~~~~~~~~~
>C1372_014 score:72 alignment:9M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGT.AS.VVC.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3383 score:63 alignment:1D8M unique:True
~ FVLTQ.SP.H~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1823_002 score:29 alignment:3M1D5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VNW.VENH.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C922_004 score:43 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSLSE..TY.DLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_392 score:33 alignment:1S[2,2]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KL.SAT.AS.FL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3717 score:36 alignment:9M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S..NL.TDCK..KY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1951 score:34 alignment:2I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DVGVL.L..L..NNTA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1517 score:57 alignment:1I4M1S[1,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DNYLAAM.YVQK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C87_003 score:45 alignment:9M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.C.E.V..GHTQL~~~~~~~~~~~~~~
>C117_013 score:33 alignment:1S[2,2]7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KL.SAT.AS.FK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_388 score:72 alignment:9M unique:True
~DFVLTQ.SP.H~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C315_009 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSAA.GT.ASF~~~~
>C598_007 score:34 alignment:5M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LLS..TL..LYK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C880_004 score:60 alignment:5M1S[2,2]2M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.LL.D.L.SAER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C921_003 score:57 alignment:1I4M1S[1,2]4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNYLAAM.YVQK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C990_006 score:53 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNYLNF.YVQK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_415 score:72 alignment:9M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.C.E.V..THQGL~~~~~~~~~~~~~~
>C168_012 score:60 alignment:6M1S[2,2]1M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.C.E.V..THGQL~~~~~~~~~~~~~~
>C268_002 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SET.VS.AVK.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C111_016 score:40 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~G.QTPQR.QL.W~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_367 score:29 alignment:5M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ALVNW.VEQ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1526_008 score:49 alignment:9M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AE.GVL.L..L..NN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C104_013 score:44 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GSTA.SLGS..TA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C841_009 score:44 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GP.G.QSSLD.LL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1126_009 score:45 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.LL.D.L.ARTD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C184_015 score:62 alignment:6M1S[2,2]1M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.C.E.V..THANL~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3248 score:29 alignment:5M1D3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ALVDW.VEQ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1357 score:54 alignment:9M unique:False
~DLVLTQ.SP.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C774_003 score:45 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~RASLA..PSVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1227 score:62 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNYLAW.YVQK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C557_003 score:36 alignment:3M1S[3,3]3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SET.VG.TVK.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1491 score:36 alignment:9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.LC.G.L.LAER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2967 score:35 alignment:1I9M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TS....PSGHVVDF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1309 score:72 alignment:9M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.LL.D.L.ASER~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C332_009 score:54 alignment:3M1S[3,3]3M unique:True
~DFVTQL.SP.H~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C187_006 score:40 alignment:9M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.LA.D.Q.AEAR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1 score:36 alignment:9M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~S..NL.TNCK..KY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C115_012 score:62 alignment:7M1S[2,2] unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~A.C.E.V..THQAV~~~~~~~~~~~~~~
>C839_006 score:41 alignment:1I5M1I4M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNYLASMYVQK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1095_006 score:42 alignment:1I5M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AW.YVQK..G.P.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_478 score:30 alignment:1I5M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VV..WHCGVTT~~~~~~~~~~~
>C2444_006 score:55 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SPQL.LL.Y.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_390 score:38 alignment:2M1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LKLTGT.AS.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1988 score:35 alignment:2I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DVGVL.L..L..NNT~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1230_004 score:31 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FEDENFLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3718 score:37 alignment:8M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LST..AAYAK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_386 score:36 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~CMQGSREPW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1040 score:64 alignment:8M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLAA..PSVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1499_009 score:36 alignment:1I8M unique:False
~~~PLTQ.SL.PLL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C617_003 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.LL.D.L.SMK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C769_005 score:41 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LL.L.L.AEGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C420_004 score:37 alignment:8M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GY..D..VD.L.MR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C270_027 score:38 alignment:1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KL.TGT.AS.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1387 score:36 alignment:1I8M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ELL.D.L.VLDR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C353_005 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LK.AST.AS.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_503 score:64 alignment:8M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SSP.VT.KSF~~~~
>C238_022 score:46 alignment:8M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LK.SAT.AS.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C988_005 score:36 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YPQL.LP.G.L.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2529 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KTSLAA..SF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C217_004 score:36 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~CMQGERSPW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3233 score:41 alignment:8M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AE.GVL.L..L..N~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2477 score:35 alignment:2M1S[1,2]5M unique:False
~~~~LCGA.SL.LSL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3654 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DNDLTLML~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C802_010 score:32 alignment:8M unique:False
~DWVLLQ.TL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C856_006 score:34 alignment:2M1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SLGLHQDGW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2697 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LK.STA.AS.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C965_012 score:36 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLL.D.L.DSRQ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_225 score:36 alignment:1I8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KLL.SAT.AS.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1588 score:38 alignment:5M1I3M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LK.TGTLAS.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3323 score:37 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ASGVFPRD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2898_002 score:36 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLVT..PEVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1484_008 score:54 alignment:1I8M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SGLAA..PSVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1023 score:64 alignment:8M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ASGVPDRF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2651 score:45 alignment:1I8M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLL.D.L.DSQR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3344 score:54 alignment:1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GTGVPDRF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C584_018 score:31 alignment:4M1S[2,2]2M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LL.E.L.TGPK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_320 score:34 alignment:1S[2,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KL.SAT.AS.F~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2306_007 score:52 alignment:2I1S[2,2]6M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SFTVAA..PSVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C79_006 score:47 alignment:7M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~SL.LHGDR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3342 score:55 alignment:1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~QSGVPDRF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C929_016 score:36 alignment:2I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DVVGL.L..L..NN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1571_002 score:37 alignment:1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NS..WL.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_541 score:36 alignment:2I7M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DVGVL.L..L..NN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3364 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L.Y.L.SSAR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1963_008 score:46 alignment:1I7M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LPQS.LL.D.L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2650 score:42 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~E..TL.TLLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C3477 score:33 alignment:1S[1,2]6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~GLV...TLVQW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_422 score:40 alignment:2I7M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NCQGRESPW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C54_015 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VQQKYSN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2696 score:51 alignment:7M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..DNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1095_010 score:56 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DFTLKLS~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2830 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~VT.WGKSF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1719 score:47 alignment:7M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLSK..ADY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C80_011 score:28 alignment:4M1S[2,2]1M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VCK..P..ANA~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_356 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VQEKSYN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C62 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VQEKYSN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2524 score:56 alignment:7M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~L..NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_189 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LAL..AKVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2611 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LNN..NL.TL~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3298 score:32 alignment:1I7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NLPF..PEVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1751 score:33 alignment:7M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TP.VA.KVF~~~~
>Combined_322 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LKLAKVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_098 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VQQKSYN~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1651 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YELAKVF~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1522_002 score:29 alignment:7M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~TLVK..SYW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C352_003 score:48 alignment:6M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NNFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C56_005 score:48 alignment:6M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KDFTLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C60_027 score:32 alignment:2I6M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~AHVEHA.LQ~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1145 score:36 alignment:2M1S[2,2]2M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KDTFLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C192_030 score:43 alignment:1S[1,2]5M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~ GLSFGRN
>C2404_005 score:45 alignment:3I6M unique:False
~TTLLTQ.SP.H~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1258 score:36 alignment:1M1S[2,2]3M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KFDTLK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1372_013 score:29 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VS.VRV.L..L~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1015 score:39 alignment:6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YCMQGR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_2468 score:35 alignment:4I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VVSAA....GSGSD~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C2481_004 score:38 alignment:1I6M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KE...ALVDW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C49_007 score:42 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YTGVPDR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3389 score:38 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LSPQL.LY~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C421_004 score:43 alignment:6M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~NDFY.PR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C368_005 score:33 alignment:1I6M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LLES..TL.K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1046_020 score:29 alignment:2I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VTALVPW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C309_008 score:29 alignment:2I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~DCL.LL.D.R~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C842_003 score:29 alignment:2I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~YVLLLSR~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>C1727_012 score:29 alignment:2I5M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~MTALVNW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3461 score:29 alignment:2I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~LTALVNW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_1256 score:29 alignment:2I5M unique:True
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~FYE.QFSK~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_606 score:29 alignment:2I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~VTALVNW~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
>Combined_3681 score:33 alignment:2I5M unique:False
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~KYGEGT..K~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~

Template Sequence

DFVLTQSPHSLSVTPGESASISCKSSHSLLHGDGHNYLFWYVQKPGQSPQLLIDLASERASGVPDRFSGSGSDKDFTLKISRVEPEDVGTYYSMQGRQTPWTFGQGTKVDIKRSLAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREALVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKAYYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFGRNEC

Recombined Template REC-0-1_002

Consensus Sequence

Annotated Consensus Sequence

Annotated Consensus Sequence (TXT)

Preview

Sequence Consensus Overview

Sequence Consensus Overview (TSV)

Preview

Variant Graph

Higher Order Variant Graph

Depth of Coverage of the Consensus Sequence?BargraphThe depth of coverage reported is the sum of all positional scores for that position. This is reported with the same position numbering as the consensus sequence.

Bargraph

Depth of Coverage of the Consensus Sequence (TSV)

Preview

Scores

Length

Score

Matches

Unique Score

Unique Matches

Order

Alignment

Reads Alignment (FASTA)

Preview

C109_002

Combined_062

C90

C128_002

C1010

Combined_3509

C105_002

C116_003

Combined_1138

C102_003

Combined_050

Combined_054

Combined_076

Combined_071

C160_003

Combined_072

Combined_077

C193_002

Combined_080

Combined_1274

C173_002

C185

C216_002

C217

C256_003

Combined_098

Combined_322

Combined_1588

Combined_189

Combined_324

Combined_264

Combined_891

Combined_356

Combined_320

Combined_225

Combined_362

Combined_2251

Combined_3248

C1700_002

Combined_392

Combined_367

C1938_002

C62

Combined_478

Combined_400

C268_002

Combined_390

Combined_666

Combined_693

Combined_415

C195_002

C201_003

Combined_386

Combined_1806

Combined_388

Combined_389

Depth of Coverage of the Consensus Sequence